股东在特定条件下可以以公司与第三人恶意串通为由提起合同无效之诉。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国民法典》（原《合同法》相关内容已纳入其中）的相关规定，恶意串通损害国家、集体或者第三人利益的合同无效。具体来说，如果股东能够证明公司与第三人之间的合同存在恶意串通，且该合同损害了股东的利益，那么股东有权提起合同无效之诉。
二、股东适格性分析
直接利害关系：
- 股东作为公司权益的最终受益者，如果公司与第三人之间的合同损害了公司的利益，进而损害了股东的利益，那么股东与该合同具有直接利害关系，符合起诉条件。
- 在实践中，法院会综合考虑股东持股比例、合同对公司及股东利益的影响等因素，来判断股东是否具有直接利害关系。
公司自治与股东保护：
- 通常情况下，公司应自行提起诉讼来维护其权益。然而，当公司被其他股东控制或不愿提起诉讼时，股东可以自己的名义起诉，要求确认合同无效。
- 这种情况下，股东的起诉并非基于公司代表诉讼，而是基于其自身作为公司权益最终受益者的身份。
三、实践案例与司法裁判
- 在多个司法实践中，法院已经认可了股东在特定条件下提起合同无效之诉的资格。例如，在王桂生与香港中成集团有限公司、浙江中成实业有限公司等股权转让纠纷案中，法院认为虽然股权转让合同系陈瑞仁代表香港盈兆公司签订，但王桂生作为公司股东，认为陈瑞仁和香港中成公司恶意串通损害其财产利益，符合起诉条件。
- 然而，股东提起此类诉讼时，必须提供充分的证据证明公司与第三人之间存在恶意串通，且该合同损害了其利益。如果证据不足，法院可能不会支持股东的诉讼请求。
四、法律建议与风险提示
收集证据：
- 股东在提起合同无效之诉前，应充分收集证据，包括合同文本、交易记录、沟通记录等，以证明公司与第三人之间存在恶意串通。
- 必要时，可以聘请专业机构进行鉴定或评估，以增强证据的说服力。
评估风险：
- 提起合同无效之诉可能涉及复杂的法律程序和较高的诉讼成本。股东在决定起诉前，应充分评估风险，包括诉讼胜诉的可能性、诉讼成本与收益的平衡等。
- 如果股东认为诉讼风险较大，可以考虑通过其他途径解决争议，如协商、调解等。
寻求专业帮助：
- 由于合同无效之诉涉及复杂的法律问题，股东在提起诉讼前应咨询专业律师的意见，以确保诉讼策略的合理性和有效性。
- 在诉讼过程中，律师可以协助股东收集证据、制定诉讼策略、参与庭审等，提高诉讼胜诉的可能性。
总结来看，股东在特定条件下可以以公司与第三人恶意串通为由提起合同无效之诉。然而，股东在提起此类诉讼时，必须确保自己与合同具有直接利害关系，并提供充分的证据证明恶意串通的存在。如果你作为股东遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。