针对您提出的“责令停产停业需要做出行政处罚案卷吗”这一问题，我可以明确地告诉您：责令停产停业作为行政处罚的一种，确实需要制作行政处罚案卷。

首先，我们来明确一下责令停产停业的法律地位。根据《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定，行政处罚的种类中明确包括了责令停产停业。这是一种行政机关对从事违法生产经营活动的公民、法人或其他组织所实施的严厉制裁措施，其目的在于纠正违法行为、消除危害后果，并维护正常的行政管理秩序。

接下来，我们谈谈为什么需要制作行政处罚案卷。行政处罚案卷是记录行政处罚全过程的重要文件，它包括了行政处罚的决定书、相关证据材料、当事人的陈述和申辩、行政机关的审查意见等多个环节。制作行政处罚案卷不仅有助于规范行政处罚程序，确保行政处罚的合法性和公正性，还能为后续的行政复议或行政诉讼提供有力的证据支持。

对于责令停产停业这种行政处罚来说，由于其涉及对当事人生产经营活动的重大限制，因此更需要通过制作详细的行政处罚案卷来记录整个处罚过程。这包括了对当事人违法行为的调查取证、行政处罚决定的作出、当事人的陈述和申辩处理、以及处罚决定的执行和复查等各个环节。

最后，关于您提到的结案问题，一般来说，责令停产停业的结案并不是以企业已经停产停业作为结案标准，而是需要以企业复查整改验收合格作为结案依据。这意味着，在责令停产停业期间，企业需要积极整改违法行为，并在整改完成后接受行政机关的复查验收。只有当复查验收合格后，行政机关才会正式结案，并允许企业恢复生产经营活动。

综上所述，责令停产停业作为行政处罚的一种，确实需要制作行政处罚案卷，并且结案需要以企业复查整改验收合格作为依据。希望这个解答能够对您有所帮助。