结论：物业作为责任人垫付赔付业主车辆损失后，通过保险理赔时，4S店能否开票需分情况讨论。以下是具体分析：

1. 保险理赔流程中的开票主体

• 若保险理赔款直接支付给4S店：
  根据保险合同约定，若保险公司与4S店直接结算维修费用（即“直赔”模式），4S店需向保险公司开具维修发票，发票抬头为保险公司。此时，物业作为垫付方无需取得发票，但需保留垫付凭证（如转账记录、业主签字确认的垫付说明）及保险理赔单据，以证明资金流向。
• 若保险理赔款支付给物业或业主：
  若保险公司将理赔款支付给物业（垫付方）或业主，再由物业/业主支付给4S店，则4S店应向实际付款方（物业或业主）开具发票。此时需注意：
  • 若物业垫付后从保险公司获得理赔款，发票抬头应为物业（需与保险公司协商调整理赔流程）；
  • 若业主自行获得理赔款后支付维修费，发票抬头应为业主。

2. 物业垫付的税务处理

• 物业作为垫付方的角色：
  物业垫付行为本质上是“代付”，若最终由保险公司承担费用，物业需确保：
  1. 垫付资金与保险理赔款一一对应；
  2. 4S店发票与实际维修服务一致；
  3. 避免重复取得发票（如已由保险公司取得直赔发票，物业无需再索要）。
• 税务风险点：
  若物业未妥善处理发票流程，可能导致：
  • 保险公司拒赔（因发票不合规）；
  • 物业被税务机关认定为“虚开发票”或“未如实申报”（如垫付资金未通过正规渠道流转）。

3. 实务建议

• 步骤1：明确保险理赔模式
  与保险公司确认是否采用“直赔”模式。若采用，物业仅需留存垫付凭证，无需介入发票流程。
• 步骤2：规范资金与发票流转
  若非直赔模式，物业应：
  1. 要求4S店向实际付款方（物业或业主）开具发票；
  2. 确保发票金额与维修费用、保险理赔款一致；
  3. 保留完整的资金流转证据（如垫付协议、理赔决定书、转账记录）。
• 步骤3：咨询专业支持
  若涉及大额垫付或复杂保险条款，建议同步咨询会计和税务专业人士，避免程序瑕疵。

总结：4S店能否开票取决于保险理赔款的支付路径。物业需根据实际模式调整发票取得主体，并确保流程合规。如有具体案例或合同条款需进一步分析，可直接向我提供细节，我将结合法律与实务为您定制解决方案。