工程结算单超过三年是否还能用，需视具体情况而定，但一般来说，若诉讼时效未过，则仍然有效并可用。以下从不同角度为您详细分析：
一、诉讼时效的基本规定
根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这一规定同样适用于建设工程领域，即基于工程结算单主张工程款等相关权利的诉讼时效也为三年。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
二、诉讼时效的起算时间
- 有明确付款时间：若工程结算单上有明确的付款时间，或合同中有约定的付款时间，则诉讼时效从应付款时起算。
- 无明确付款时间：若工程结算单及合同中均未明确付款时间，则诉讼时效从发包人拒付结算工程款，即债权人知道或应当知道权利受到侵害时起算。
- 中间结算：对于中间结算，其诉讼时效期间从最后一期付款期间届满时再加三年。
三、诉讼时效的中断与延长
- 诉讼时效中断：在诉讼时效期间内，如果权利人向义务人提出履行请求（如发送催款通知）、义务人同意履行义务等情形，可导致诉讼时效中断，并重新计算三年。这意味着，即使工程结算单已经超过三年，但如果在此期间内有诉讼时效中断的情形，那么结算单仍然有效并可用。
- 诉讼时效延长：在诉讼时效期间的最后六个月内，因不可抗力等原因导致权利人不能行使请求权的，诉讼时效中止。自中止原因消除之日起满六个月后，诉讼时效期间届满。此外，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，但有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
四、合同约定的优先性
在建设工程合同或相关补充协议中，若当事人双方明确约定了工程结算单的有效期限，则应严格遵循该约定执行。例如，合同中规定结算单在出具后的某一段时间内（如6个月）内有效，那么此约定具有法律约束力。
五、实际建议
- 及时主张权利：为了避免诉讼时效过期，建议您在工程结算单出具后，及时与对方进行沟通并主张权利。
- 保留证据：无论是否超过三年，都应保留好与工程结算单相关的所有证据，如合同、付款记录、沟通记录等，以备不时之需。
- 咨询专业律师：如果您对工程结算单的有效性有疑问，或担心诉讼时效问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见。
举例说明：假设一份工程结算单于2020年1月1日出具，且合同中未明确付款时间。若发包人于2023年1月1日拒付工程款，则诉讼时效从此时起算三年，即至2026年1月1日。若在此期间内，承包人向发包人发送了催款通知，则诉讼时效中断并重新计算三年。因此，即使工程结算单已经超过三年，但只要诉讼时效未过或存在中断情形，则仍然有效并可用。