发包人在收到其他法院的执行裁定及协助执行通知后，对于承包人起诉的工程款，一般不能直接支付给承包人，但存在例外情况。以下从不同角度进行分析：
一、一般原则：协助执行义务
根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释的规定，当发包人收到法院的执行裁定及协助执行通知时，发包人负有协助执行的义务。这意味着发包人需要按照法院的要求，将应支付的款项（如工程款）直接支付给申请执行人（即其他案件的债权人），而不是支付给承包人。这是为了保障申请执行人的合法权益，防止被执行人（如发包人可能涉及的债务人）通过转移财产等方式逃避执行。
二、例外情况：合同约定与法院许可
合同约定：如果发包人与承包人之间的合同中有特别约定，比如约定在特定情况下发包人可以直接支付工程款给承包人，且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么发包人可能在一定程度上享有支付工程款的自主权。但这种情况较为特殊，且需要合同双方有明确的约定。
法院许可：在某些特殊情况下，如果发包人能够证明支付工程款给承包人不会损害申请执行人的利益，或者已经得到了法院的许可，那么发包人可能可以支付工程款给承包人。这通常需要发包人向法院提出申请，并提交相关证据材料，由法院进行审查并作出决定。
三、法律后果与风险提示
法律后果：如果发包人未经法院许可，擅自将工程款支付给承包人，可能构成对协助执行义务的违反。根据法律规定，法院有权对发包人进行罚款、拘留等处罚，并可能要求发包人承担相应的赔偿责任。
风险提示：对于发包人而言，在收到法院的执行裁定及协助执行通知后，应谨慎处理与承包人之间的工程款支付问题。建议发包人及时与法院沟通，了解具体的协助执行要求，并在必要时寻求法律帮助，以避免因不当支付而引发的法律风险。
四、建议与操作指南
及时沟通：发包人应尽快与发出执行裁定及协助执行通知的法院取得联系，了解具体的协助执行要求和程序。
审查合同：发包人应仔细审查与承包人之间的合同，看是否存在可以支付工程款的特别约定。
申请许可：如果发包人认为有必要支付工程款给承包人，且不违反法律法规的强制性规定，可以向法院提出申请，并提交相关证据材料。
寻求法律帮助：在整个过程中，发包人可以寻求专业律师的法律帮助，以确保自己的合法权益得到保障。
总结：发包人在收到其他法院的执行裁定及协助执行通知后，对于承包人起诉的工程款，一般不能直接支付给承包人。但存在合同约定或法院许可等例外情况。发包人应谨慎处理此事，及时与法院沟通，并在必要时寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。