核心结论：发包人工程款先收到协助执行通知，自身又被判决执行的，需根据协助执行与自身判决执行的具体情况，分不同角度处理，主要有以下几种情况。

1. 协助执行优先原则下的处理
   • 法律依据：根据《民事诉讼法》及相关司法解释，当发包人收到法院协助执行通知，要求其协助冻结、划拨工程款以支付申请执行人时，发包人有义务配合法院执行工作。若此时发包人自身又被其他法院判决执行，从协助执行优先的角度出发，发包人应先履行协助执行义务。
   • 具体操作：发包人应及时与发出协助执行通知的法院沟通，说明自身已被其他法院判决执行的情况，但原则上仍需按照协助执行通知的要求，将相应工程款划拨至指定账户。在完成协助执行义务后，若发包人仍有剩余财产可供执行，再配合其他法院的执行工作。例如，发包人收到A法院协助执行通知，要求划拨100万元工程款给申请执行人甲，同时发包人自身又被B法院判决向申请执行人乙支付80万元。发包人应先将100万元划拨给甲，若发包人账户还有剩余资金，再配合B法院向乙支付80万元。
2. 自身判决执行优先的特殊情形
   • 法律依据：在某些特殊情况下，如协助执行通知存在瑕疵、自身判决执行涉及重大民生或社会公共利益等，发包人可能可以主张自身判决执行优先。但这种情况需要严格的法律程序和证据支持。
   • 具体操作：发包人若认为自身判决执行应优先，应及时向发出协助执行通知的法院提出书面异议，说明理由并提供相关证据。法院会对异议进行审查，若认为异议成立，可能会中止协助执行程序，先处理发包人自身的判决执行。例如，发包人自身判决执行涉及员工工资发放，关系到众多员工的生计和社会稳定，而协助执行通知的申请执行人债权并非紧迫性债权，此时发包人提出异议，法院经审查后可能中止协助执行，先保障员工工资的支付。
3. 协调沟通与财产分配方案
   • 法律依据：为了避免不同法院执行程序之间的冲突和矛盾，保障各方当事人的合法权益，发包人可以积极与相关法院沟通协调，寻求制定合理的财产分配方案。
   • 具体操作：发包人可以主动联系发出协助执行通知的法院和自身判决执行的法院，说明情况，提出财产分配的建议。例如，根据各债权人的债权比例、债权性质等因素，制定一个公平合理的分配方案，提交给法院审查。若法院认为方案可行，会按照方案进行执行。这样可以避免发包人因同时面临多个执行程序而陷入困境，也能保障各债权人的利益得到相对公平的实现。

后续建议：在整个处理过程中，发包人应保留好所有与协助执行和自身判决执行相关的文件、通知、沟通记录等证据，以便在需要时维护自己的合法权益。若在处理过程中遇到复杂情况或不确定如何操作，可直接向我咨询，我会根据具体情况为你提供详细的法律建议。