合同法人未签字但盖有公章，而法人不承认的情况下，合同一般仍然是生效的。以下从不同角度为您详细分析：
法律角度
根据《民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在合同中，法人作为主体，其盖章行为具有与签字同等的法律效力，意味着法人对合同内容的认可。因此，只要合同不存在其他导致无效或可撤销的法定情形，如违反法律法规强制性规定、存在欺诈胁迫等情形，仅法人未签字但盖有公章，合同通常自盖章时成立并生效。
实际操作与证据角度
公章的真实性与合法性：
- 如果公章是真实且合法使用的，那么它代表了法人的意志，即使法人未签字，合同也通常被视为有效。
- 如果公章是伪造或非法使用的，那么合同可能因缺乏法人的真实意思表示而被认定为无效。
法人的不承认与证据收集：
- 法人不承认合同，可能构成对合同效力的争议。此时，需要收集其他证据来证明合同的真实性和合法性，如合同履行过程中的相关证据（如交货单、收款凭证等）、双方沟通记录等。
- 如果能够证明合同是双方真实意思的表示，且符合法律规定的生效条件，那么即使法人未签字，合同也可能被认定为有效。
特殊情况与风险防范
特殊约定：
- 如果合同中有特别约定必须法人签字才生效，那么仅有公章就不符合条件，合同可能不生效。
- 因此，在签订合同时，应明确约定合同的生效条件，以避免后续争议。
风险防范：
- 为了降低风险，建议在签订合同时，尽量要求法人签字并加盖公章。
- 如果法人因故无法签字，可以要求其出具书面授权委托书，明确授权某人代为签字，并加盖公章。
后续行动建议
与法人沟通：
- 尝试与法人进行沟通，了解其不承认合同的原因，并寻求解决方案。
- 如果法人愿意承认合同并履行义务，那么问题可能得到妥善解决。
法律途径：
- 如果沟通无果，且您认为合同是有效且应履行的，可以考虑通过法律途径解决争议。
- 可以向法院提起诉讼，要求确认合同的效力并判决对方履行义务。
总结与建议：合同法人未签字但盖有公章，而法人不承认的情况下，合同一般仍然是生效的。但为了避免后续争议和风险，建议在签订合同时尽量要求法人签字并加盖公章。如果遇到问题，可以及时咨询我，我会根据您的具体情况提供进一步的法律建议。