合同诈骗立案证据不足两年后，若犯罪嫌疑人逃避侦查或审判，则证据仍然有效，司法机关可继续追诉；若犯罪嫌疑人未逃避，则需视具体情况判断证据效力及追诉可能性。以下从不同角度进行详细分析：
一、追诉时效的基本原则
追诉时效是刑法规定的对犯罪人进行刑事追诉的有效期限。一般情况下，犯罪经过一定期限后，将不再追诉。这是为了保障法律的稳定性和可预测性，避免对犯罪人进行无休止的追诉。然而，在合同诈骗等刑事案件中，追诉时效的适用并非绝对。
二、立案后追诉时效的特殊规定
不受追诉时效限制的情形：
- 根据《刑法》第八十八条的规定，在司法机关立案侦查或者受理案件以后，犯罪嫌疑人逃避侦查或者审判的，不受追诉期限的限制。这意味着，如果合同诈骗案件已经立案，且犯罪嫌疑人潜逃或采取其他方式逃避侦查或审判，那么无论过了多久，只要犯罪嫌疑人未归案，司法机关都有权继续追诉。
证据的有效性与追诉：
- 证据的有效性并不直接受时间限制，而是受证据收集、保存和证明力的影响。在合同诈骗案件中，如果立案时证据不足，但后续通过其他方式补充了证据，或者原有证据在保存过程中未受损毁、篡改，那么这些证据在两年后仍然可能具有证明力。
- 关键在于，司法机关在追诉时需要能够证明犯罪嫌疑人的犯罪事实，且证据确实、充分。如果证据不足，司法机关可能无法直接定罪，但可以通过进一步侦查、补充证据等方式来完善案件。
三、犯罪嫌疑人未逃避侦查或审判的情况
- 如果合同诈骗案件立案后，犯罪嫌疑人未逃避侦查或审判，且证据在两年内未得到充分补充或证明力不足，那么司法机关在追诉时可能会面临困难。此时，司法机关需要评估证据的充分性和证明力，以决定是否继续追诉。
- 在这种情况下，犯罪嫌疑人可能会以“超过追诉时效”为由进行抗辩。然而，如果司法机关能够证明犯罪嫌疑人的犯罪事实，并且证据确实、充分，那么即使超过了通常的追诉时效，司法机关仍然有权进行追诉。但这种情况较为罕见，且需要严格的证据支持。
四、法律建议与后果
对于受害者：
- 如果发现合同诈骗行为，应及时向公安机关报案，并尽可能提供充分的证据。
- 在案件立案后，应积极配合司法机关的侦查工作，提供必要的协助和信息。
- 如果担心追诉时效问题，可以咨询专业律师，了解相关法律规定和司法实践。
对于犯罪嫌疑人：
- 如果涉嫌合同诈骗，应尽快向司法机关投案自首，争取从轻处理。
- 逃避侦查或审判将导致不受追诉时效的限制，增加被追诉的风险。
- 应积极配合司法机关的调查工作，如实陈述事实，提供相关证据。
可能的法律后果：
- 如果合同诈骗行为得到证实，犯罪嫌疑人将面临刑事处罚，包括有期徒刑、罚金等。
- 如果证据不足或无法证明犯罪事实，犯罪嫌疑人可能不会被定罪，但也可能面临其他法律后果，如民事赔偿等。