企业通过灵活用工进行转账发工资是否违法，需分情况讨论：
合法情况：
- 合规的灵活用工模式：若企业与劳动者之间建立了合法的劳动关系或劳务关系，并且通过灵活用工平台（该平台需具备合法资质）进行工资转账，同时确保了工资支付的透明度、及时性和足额性，且依法代扣代缴了个人所得税，那么这种转账发工资的方式是合法的。
- 明确的合同关系：企业与灵活用工人员签订了明确的合同，规定了工作内容、报酬支付方式等关键条款，且合同内容合法合规，那么通过转账方式支付工资也是被允许的。
违法情况：
- 逃避税务或社保义务：如果企业通过灵活用工转账发工资的方式，是为了逃避税务或社保缴纳义务，比如未依法代扣代缴个人所得税，或者未为劳动者缴纳社会保险费，那么这种行为就是违法的。
- 虚构劳动关系：企业通过虚构劳动关系，利用灵活用工平台进行工资转账，以规避法律责任或获取不正当利益，这也是违法的。例如，企业可能将本应直接支付给员工的工资，通过灵活用工平台转账给无实际劳动关系的第三方，再由第三方以其他形式返还给员工，以此逃避税务和社保监管。
- 违反最低工资标准：如果企业通过灵活用工转账发工资的方式，导致劳动者的实际工资低于当地最低工资标准，那么这种行为同样违法。
法律背景与建议：
- 法律背景：根据《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》以及《中华人民共和国税收征收管理法》等相关法律法规，企业应当依法与劳动者建立劳动关系，按时足额支付劳动报酬，并依法代扣代缴个人所得税，同时为劳动者缴纳社会保险费。
- 建议：
- 确保合规性：企业在采用灵活用工模式时，应确保与劳动者之间建立了合法的劳动关系或劳务关系，并签订明确的合同。
- 依法纳税和缴纳社保：企业应依法代扣代缴个人所得税，并为劳动者缴纳社会保险费，避免逃避税务或社保义务。
- 保留相关证据：企业应保留与灵活用工人员之间的合同、工资支付记录等相关证据，以备查验。
可能的法律后果：
- 如果企业通过灵活用工转账发工资的方式违法，可能会面临税务部门的罚款、社保部门的追缴以及劳动者的法律诉讼等后果。
- 在严重情况下，企业还可能因逃避税务或社保义务而承担刑事责任。
如果有任何关于劳动工伤（工资福利）方面的法律问题，可以直接向我咨询。