员工违纪，公司一般不能直接报案，但需根据违纪性质和后果来具体判断。以下从不同角度进行分析：
员工违纪的性质：
- 一般违纪：如迟到、早退、轻微违反公司规章制度等，这些行为通常属于公司内部管理范畴，公司可以通过内部纪律处分（如警告、罚款、解除劳动合同等）来处理，无需报案。
- 严重违纪或违法行为：如果员工的行为涉嫌违法，如盗窃公司财物、泄露商业秘密、故意伤害他人等，公司应当及时向公安机关报案，并配合调查。此时，报案是公司维护自身权益和公共利益的必要手段。
报案的法律依据：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，任何单位和个人发现有犯罪事实或者犯罪嫌疑人，有权利也有义务向公安机关报案或者举报。因此，如果员工的行为涉嫌犯罪，公司有权报案。
- 但对于一般的违纪行为，由于不涉及犯罪，公司无权直接报案，而应通过内部管理机制或劳动争议解决途径来处理。
报案后的法律后果：
- 如果公司报案后，经公安机关调查认定员工的行为构成犯罪，员工将面临刑事处罚。
- 如果公司报案后，经调查认定员工的行为不构成犯罪，但违反了公司规章制度或劳动合同约定，公司可以依据内部规定或劳动合同对员工进行纪律处分。
- 如果公司错误报案或滥用报案权，可能会面临员工提起的民事诉讼，要求公司承担侵权责任。
建议与注意事项：
- 完善内部管理制度：公司应建立健全内部管理制度，明确员工的行为规范和违纪处理程序，以便在员工违纪时能够及时、有效地进行处理。
- 依法处理违纪行为：对于员工的违纪行为，公司应依法进行处理，避免滥用权力或侵犯员工合法权益。
- 及时报案涉嫌犯罪行为：如果员工的行为涉嫌犯罪，公司应及时向公安机关报案，并配合调查，以维护自身权益和公共利益。
- 保留证据：在处理员工违纪行为时，公司应保留相关证据，如监控录像、聊天记录、证人证言等，以便在需要时提供证明。
总结来说，员工违纪时，公司能否报案取决于违纪行为的性质和后果。对于一般违纪行为，公司应通过内部管理机制或劳动争议解决途径来处理；对于涉嫌犯罪的行为，公司应及时向公安机关报案。在处理过程中，公司应依法行事，保留相关证据，并避免滥用权力或侵犯员工合法权益。如果有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。