结论前置：

1. 乙方在甲方到期货款不付的情况下，有权利停止发货。
2. 若乙方停止发货，甲方无权仅因乙方延期发货而扣除货款或要求赔偿，除非合同中有明确约定。

法律分析：

首先，从合同法的角度来看，货物买卖合同是双方意思表示一致的协议，其中包含了双方的权利和义务。在货物买卖合同中，甲方有义务按照约定的时间和金额支付货款，而乙方则有义务按照约定的时间和质量交付货物。当甲方到期货款不付时，这构成了对乙方权利的侵害，乙方有权采取相应的措施来保护自己的权益。

关于乙方停止发货的权利：

• 合同履行抗辩权：在合同法中，存在一种称为“同时履行抗辩权”或“先履行抗辩权”的制度。当一方未按照合同约定履行其义务时，另一方有权拒绝履行相应的义务。在本案例中，甲方未按照约定支付货款，乙方作为先履行义务的一方（或同时履行义务的一方，具体取决于合同条款），有权拒绝继续发货，以保护自己的合法权益。
• 合同解除权：如果甲方的违约行为严重到导致合同目的无法实现，乙方还有权解除合同，并要求甲方承担违约责任。虽然停止发货并不直接等同于解除合同，但它是乙方在甲方违约时采取的一种合理且合法的自我保护措施。

关于甲方扣款的问题：

• 合同约定优先：如果货物买卖合同中明确约定了乙方在甲方未支付货款时有权停止发货，并且没有约定甲方可以因此扣款或要求赔偿，那么甲方无权仅因乙方延期发货而扣除货款或要求赔偿。
• 无约定时的处理：如果合同中没有相关约定，甲方扣款或要求赔偿的行为可能缺乏法律依据。此时，乙方可以要求甲方继续履行合同（如支付货款），或者如果合同已经无法继续履行，可以要求甲方承担违约责任（如赔偿损失）。但需要注意的是，乙方在停止发货前应确保自己的行为符合合同约定和法律规定，以避免被甲方反诉违约。

建议与风险提示：

• 审查合同条款：乙方在采取任何行动前，应仔细审查货物买卖合同的条款，确保自己的行为符合合同约定。
• 与甲方协商：在可能的情况下，乙方可以尝试与甲方进行协商，寻求双方都能接受的解决方案，如分期付款、延期发货等。
• 保留证据：无论采取何种行动，乙方都应保留好相关证据，如合同、付款记录、沟通记录等，以备不时之需。
• 寻求法律帮助：如果双方无法达成一致，或者甲方的行为严重侵害了乙方的权益，乙方可以寻求法律帮助，通过诉讼或仲裁等方式来维护自己的合法权益。

最后，需要强调的是，每个案件的具体情况都有所不同，因此在实际操作中，乙方应根据自己的具体情况和合同条款来采取相应的措施。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。