化合物制备的药物组合物是否构成化合物侵权，需根据具体情况判断，一般不直接等同于侵权，但可能涉及侵权情形。以下从不同角度为您详细分析：
一、化合物侵权与药物组合物侵权的基本概念
化合物侵权：通常指的是未经授权，擅自使用、制造、销售或进口他人享有专利权的化合物，或者使用与专利化合物实质相同的方法进行生产等行为。
药物组合物侵权：则是指未经授权，擅自使用、制造、销售或进口包含特定化合物（可能受专利保护）的药物组合物，或者使用与专利药物组合物实质相同的方法进行生产等行为。药物组合物可能包含多种化合物，其专利保护范围可能涉及组合物的整体配方、制备方法或用途等。
二、化合物制备的药物组合物是否构成侵权的判断标准
专利保护范围：
- 首先，需要明确化合物和药物组合物是否均受专利保护。如果化合物本身受专利保护，但药物组合物未受保护，那么仅制备药物组合物可能不构成对化合物专利的直接侵权。然而，如果药物组合物的制备方法或用途受专利保护，且制备过程中使用了受专利保护的化合物，则可能构成侵权。
- 反之，如果药物组合物整体受专利保护，那么无论其中包含的化合物是否单独受保护，制备该药物组合物都可能构成侵权。
实质相同性：
- 侵权判断的关键在于被控侵权的产品或方法是否与专利产品或方法实质相同。对于化合物制备的药物组合物，如果其配方、制备方法或用途与专利药物组合物实质相同，即使化合物本身未直接受专利保护，也可能因整体组合物的相似性而构成侵权。
合法来源与合理使用：
- 如果制备药物组合物的化合物有合法来源，且制备行为符合合理使用的条件（如用于研究、教学或个人使用等非商业目的），则可能不构成侵权。然而，在商业领域，这种合法来源和合理使用的抗辩通常难以成立。
三、可能涉及的侵权情形及法律后果
直接侵权：
- 如果未经专利权人许可，擅自制备、销售或进口受专利保护的药物组合物，且该行为落入专利保护范围，则构成直接侵权。专利权人有权要求停止侵权行为、赔偿损失等。
间接侵权：
- 在某些情况下，即使未直接实施侵权行为，但如果为直接侵权行为提供了实质性帮助（如提供原料、设备或技术指导等），也可能构成间接侵权。间接侵权人同样需要承担法律责任。
四、建议与措施
进行专利检索与分析：
- 在制备化合物制备的药物组合物前，务必进行全面的专利检索与分析，以明确相关化合物和药物组合物的专利保护状况。这有助于避免潜在的侵权风险。
寻求专利许可或合作：
- 如果发现拟制备的药物组合物可能涉及受专利保护的化合物或组合物，建议与专利权人协商寻求专利许可或合作。通过合法途径获得授权，可以降低侵权风险并促进技术创新。
咨询专业律师：
- 在涉及复杂的专利侵权问题时，建议咨询专业律师以获取准确的法律意见和策略建议。作为专注于医疗纠纷和侵权纠纷领域的律师，我可以为您提供专业的法律服务和支持。
如果您在化合物制备的药物组合物方面遇到具体的法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。