结论：超市安排员工上班9小时，中间有1小时吃饭时间，且实行单休制度，是否合法需结合具体情况判断，但在一般情况下，若符合每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时，且保证劳动者每周至少休息1日的规定，同时扣除吃饭时间后实际工作时间未超标，则该安排合法。以下从不同角度进行分析：
一、工作时间与休息时间的法律规定
根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定：
- 每日工作时间：国家实行劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时的工时制度。
- 休息时间：用人单位应当保证劳动者每周至少休息1日。
- 延长工作时间：用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过1小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过3小时，但是每月不得超过36小时。
二、针对超市工作安排的具体分析
每日工作时间：
- 超市安排员工上班9小时，但中间有1小时吃饭时间。若这1小时吃饭时间不计入工作时间，则员工实际工作时间为8小时，符合每日工作时间不超过8小时的规定。
- 若吃饭时间计入工作时间（即员工需在岗位上吃饭或吃饭时间受工作限制），则员工实际工作时间为9小时，超过了每日8小时的标准。但这种情况是否违法还需看是否满足延长工作时间的条件，以及是否支付了相应的加班费。
每周工作时间与休息时间：
- 超市实行单休制度，即每周休息1日，符合用人单位应当保证劳动者每周至少休息1日的规定。
- 若员工每周工作6天，每天工作8小时（扣除吃饭时间后），则每周工作时间为48小时，超过了平均每周44小时的标准。但同样，这种情况是否违法还需看是否满足延长工作时间的条件，以及是否支付了相应的加班费。
三、合法性判断与建议
合法性判断：
- 若超市安排员工每天工作8小时（扣除吃饭时间后），且每周工作不超过44小时（或满足延长工作时间的条件并支付了加班费），同时保证员工每周至少休息1日，则该安排合法。
- 若超市安排员工每天工作超过8小时（扣除吃饭时间后仍超标），或每周工作超过44小时且未满足延长工作时间的条件或未支付加班费，则该安排违法。
建议：
- 超市应合理安排员工的工作时间和休息时间，确保符合劳动法的规定。
- 若需延长工作时间，应与员工协商并支付相应的加班费。
- 员工有权拒绝违法的工作安排，并可向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
总结：超市的工作安排是否合法需结合具体情况判断。若符合每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时，且保证劳动者每周至少休息1日的规定，同时扣除吃饭时间后实际工作时间未超标，则该安排合法。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。