核心结论：签完股权转让协议后法人跑路，您可以通过以下途径维护自身权益：一是依据协议追究违约责任，二是通过法律程序追回损失或确认股权归属。
具体分析如下：
追究违约责任：
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第五百七十七条，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。
- 操作建议：首先，检查股权转让协议中是否明确约定了违约责任条款，如违约金、赔偿损失等。若有，可直接依据协议向对方主张权利；若无明确约定，仍可依据法律规定，要求对方赔偿因违约行为给您造成的实际损失，包括直接损失（如已支付的款项）和间接损失（如预期利益损失）。
- 注意事项：在主张权利时，需保留好协议原件、付款凭证、沟通记录等证据，以证明对方违约事实及您的损失情况。
通过法律程序追回损失或确认股权归属：
- 诉讼途径：若法人跑路导致无法直接协商解决，您可向法院提起诉讼，要求确认股权转让协议的效力，并判决对方履行协议义务（如办理股权变更登记）或赔偿损失。
- 财产保全：在诉讼过程中，为防止对方转移财产，您可申请法院采取财产保全措施，如冻结对方银行账户、查封财产等。
- 执行阶段：若判决生效后对方仍不履行，您可申请法院强制执行，通过拍卖、变卖对方财产等方式实现债权。
- 特殊情形处理：若法人跑路导致公司陷入僵局，您还可考虑通过公司解散之诉等途径，解决公司内部治理问题，进而维护自身股权权益。
额外建议：
- 在处理此类纠纷时，建议及时咨询并委托专业律师介入，以确保法律程序的正确性和效率。
- 同时，关注公司动态，与其他股东保持沟通，共同应对可能出现的风险。
如有进一步疑问或需要具体法律帮助，请直接向我咨询。