结论：约定一年协议价格在税务上是否有效，需结合协议性质、内容合法性及税务合规性综合判断，以下分情况说明：

1. 协议性质合法且内容明确时，税务上通常有效

若协议属于合法民事合同（如买卖、服务、租赁等），且价格条款不违反法律强制性规定（如不涉及价格欺诈、垄断定价、逃避税收等），则协议价格在税务上具有法律效力。税务机关在征税时，一般会尊重合同双方约定的价格作为计税依据。
示例：甲乙签订一年期设备租赁协议，约定年租金10万元，该价格若符合市场行情且无其他违法情形，税务机关会按此金额征收房产税、增值税等。

2. 协议价格明显偏离市场价时，税务机关可能调整

若协议价格显著低于或高于市场合理水平，且无合理商业理由（如关联交易、避税目的），税务机关有权根据《税收征收管理法》第三十五条，对计税依据进行核定调整。
关键点：

• 关联交易：企业与关联方签订的价格若不符合独立交易原则（如母子公司间低价转让资产），税务机关可按市场价重新定价。
  
• 避税安排：若协议价格被认定为以避税为目的（如虚构交易、转移利润），税务机关可能否定其效力，并追缴税款及滞纳金。
  示例：A公司以1元价格将房产“卖给”关联方B公司，明显低于市场价且无合理理由，税务机关可能按评估价核定征收契税、增值税等。

3. 协议违反税收法规时，税务上无效

若协议价格条款直接违反税收法律（如约定“包税条款”即由一方承担全部税款但未依法申报），或协议目的为逃避纳税义务（如虚假交易、阴阳合同），则该条款在税务上无效，且可能面临行政处罚或刑事责任。
示例：甲乙签订销售合同，约定“发票金额100万，但实际收款200万，差额100万不开发票”，此条款因逃避增值税、企业所得税而被认定为无效，税务机关可追缴税款并处罚款。

4. 税务合规建议

• 价格合理性：协议价格应符合市场行情，保留成本、利润等支撑材料。
  
• 关联交易：关联方定价需符合独立交易原则，必要时进行税务备案或申请预约定价安排。
  
• 合同条款：避免约定“包税”“不开票”等违法内容，明确税款承担方式（如“含税价”或“不含税价”）。
  
• 留存证据：保存合同、付款凭证、市场调研报告等，以备税务检查。

总结：一年协议价格在税务上的有效性取决于协议合法性、价格合理性及税务合规性。若协议真实、合法且无避税目的，税务机关一般会认可；若存在价格异常或违法情形，则可能被调整或否定。如有具体协议需审查，可直接向我提供细节进一步分析。