结论：流转取得村集体水库后，是否还需要通过拍卖取得经营权，需根据具体情况判断，主要分为以下两种情形：

1. 若流转行为已合法取得完整经营权，则无需再拍卖

根据《民法典》及《农村土地承包法》相关规定，若通过合法流转（如承包、租赁、转让等）从村集体取得水库的完整经营权（包括使用权、收益权、管理权等），且流转程序符合法律要求（如经村民会议或村民代表会议同意、签订书面合同、备案登记等），则无需再通过拍卖程序取得经营权。
关键点：

• 流转合同需明确约定经营权范围及期限；
  
• 流转行为需经村集体民主程序决议通过；
  
• 需办理相关权属变更或备案手续（如水利部门登记）。
  

2. 若流转仅取得部分权利或程序存在瑕疵，则可能需通过拍卖补正

若流转行为存在以下情形，可能需通过拍卖程序重新取得经营权：

• 流转程序违法：如未履行民主议定程序、未签订书面合同、未备案登记等；
  
• 权利范围受限：如流转合同仅约定使用权，未明确收益权或管理权；
  
• 政策或规划调整：若当地政府对水库经营权有特殊规定（如必须通过公开竞价方式配置），则需按政策执行。
  法律依据：
  
• 《民法典》第344条（建设用地使用权流转限制）；
  
• 《水利部关于加强农村水利设施产权制度改革的指导意见》（明确经营权配置需公开、公平、公正）。
  

实务建议

1. 核查流转合同：确认合同是否明确约定“经营权”及具体权利范围；
   
2. 补全程序手续：若程序存在瑕疵，及时与村集体协商补正（如补签合同、补办备案）；
   
3. 咨询政策要求：向当地水利部门或农业农村部门了解经营权配置的具体规定。
   

提示：水库经营权涉及公共利益，法律对配置程序有严格限制。若对流转效力或拍卖必要性存疑，可直接向我提供合同文本及流转程序细节，我将进一步分析。