在交警出具事故认定书后，双方达成协议通常不会对事故的最终处理产生负面影响，但具体影响还需根据协议内容、履行情况以及是否存在后续争议等因素来综合判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 协议内容合法有效

• 合法性：如果双方达成的协议内容合法，不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么该协议通常具有法律效力。这意味着，一旦协议达成并履行，双方就应当按照协议内容来执行，不得随意反悔或变更。
• 有效性：有效的协议能够明确双方的权利和义务，减少后续争议的可能性。因此，在达成协议时，双方应当确保协议内容明确、具体，并尽可能考虑到所有可能的情况。

2. 协议履行情况

• 完全履行：如果双方能够按照协议内容完全履行各自的义务，那么该协议就不会对事故的最终处理产生任何负面影响。相反，它还能够促进双方关系的和谐，减少不必要的法律纠纷。
• 部分履行或未履行：如果一方或双方未能按照协议内容履行义务，那么另一方有权要求履行或寻求法律救济。在这种情况下，协议虽然存在，但可能因履行问题而引发新的争议。

3. 是否存在后续争议

• 无后续争议：如果双方在达成协议后，没有就事故处理产生任何后续争议，那么该协议就是成功的，且不会对事故的最终处理产生负面影响。
• 有后续争议：如果双方在达成协议后，仍然就事故处理存在争议（如赔偿金额不足、责任划分不清等），那么这些争议可能需要通过法律途径来解决。在这种情况下，虽然协议本身可能不会直接导致法律纠纷，但争议的存在可能会影响协议的履行和事故的最终处理。

4. 法律建议

• 确保协议合法有效：在达成协议前，双方应当确保协议内容合法、有效，并尽可能咨询专业律师的意见。
• 明确协议内容：协议内容应当明确、具体，包括赔偿金额、履行方式、履行期限等关键条款。
• 履行协议义务：双方应当按照协议内容履行各自的义务，避免因履行问题而引发新的争议。
• 保留相关证据：在达成协议和履行协议过程中，双方应当保留相关证据（如协议文本、付款凭证等），以备不时之需。

如果有任何关于交通事故处理或协议履行的疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，提供专业的法律建议和帮助。