结论：在签订合同的酒店存在部分违章建筑被拆除并影响酒店运营的情况下，责任归属需根据具体情况判断，可能涉及酒店方、合同相对方或第三方（如政府）的责任。以下从不同角度进行分析。
一、酒店方责任
合同履行瑕疵：
- 若酒店方在签订合同时未明确告知酒店存在违章建筑，或故意隐瞒该事实，导致合同相对方在不知情的情况下签订合同，酒店方可能构成合同欺诈或至少存在合同履行瑕疵。
- 法律依据：根据《民法典》的相关规定，合同当事人应当遵循诚实信用原则，如实告知与合同有关的重要事实。若酒店方未履行该义务，应承担相应的违约责任。
违约责任：
- 若因违章建筑被拆除导致酒店无法按照合同约定提供服务（如住宿、餐饮等），酒店方可能构成违约，需承担违约责任。
- 违约责任形式：包括但不限于赔偿损失、继续履行（若可能）、采取补救措施等。
二、合同相对方责任
合同解除权：
- 若合同相对方因酒店违章建筑被拆除而无法实现合同目的（如无法入住酒店），可能享有合同解除权。
- 法律依据：根据《民法典》的相关规定，在合同目的无法实现的情况下，当事人可以解除合同。
损害赔偿请求权：
- 若合同相对方因酒店违章建筑被拆除而遭受损失（如另行安排住宿的费用），有权向酒店方请求损害赔偿。
三、第三方（如政府）责任
行政行为合法性：
- 若政府因公共利益需要拆除违章建筑，且该行政行为合法，则政府通常不承担民事责任。
- 例外情况：若政府在拆除过程中存在违法行为（如程序违法、超范围拆除等），可能需承担相应的行政责任或民事责任。
补偿义务：
- 在某些情况下，政府可能因拆除违章建筑而对酒店方或合同相对方造成损失，但通常这种补偿义务是针对合法建筑或合法权益的。对于违章建筑，政府一般不负有补偿义务。
四、综合分析与建议
审查合同条款：
- 首先应审查合同中关于酒店设施、服务内容以及违约责任的条款，以确定双方的权利义务。
收集证据：
- 收集与违章建筑被拆除相关的证据（如政府通知、拆除现场照片等），以及因拆除导致的损失证据（如另行安排住宿的费用发票等）。
协商与诉讼：
- 尝试与酒店方进行协商，寻求和解或赔偿方案。
- 若协商无果，可考虑通过法律途径解决纠纷，如提起民事诉讼或申请仲裁。
进一步思考：在处理此类纠纷时，还需考虑合同的具体性质（如租赁合同、服务合同等）、双方当事人的过错程度以及实际损失情况等因素。因此，建议当事人在处理此类纠纷时，及时咨询专业律师，以便更准确地判断责任归属并维护自身合法权益。若您有任何法律问题，都可以直接向我咨询。