针对您提出的“违规领取补助金当事人已死亡怎么处理”的问题，这是一个涉及社会救助资金管理和法律责任的重要议题。以下是我根据相关法律法规和实际案例，为您提供的详细解答：

一、法律责任与原则

首先，需要明确的是，最低生活保障金等社会救助资金是国家专项资金，用于保障特定困难群体的基本生活需求。这些资金的管理和发放必须严格遵守法律法规，确保资金的安全和有效使用。当发现违规向不具备资格的人员（如已故人员）发放补助金时，相关行政机关有责任依法进行追缴，以维护国家利益和社会公平。

二、处理流程与措施

1. 发现违规情况：

   • 通常，这一发现可能源于定期的审核、审计或公众举报。一旦发现违规领取补助金的情况，特别是当事人已死亡的情况，应立即启动调查程序。

2. 发出检察建议或行政指令：

   • 检察机关或相关行政机关在发现违规情况后，会依法向负责发放补助金的部门（如民政局）发出检察建议或行政指令，要求其对违规发放的补助金进行依法处理。

3. 采取追缴措施：

   • 负责发放补助金的部门在收到建议或指令后，应立即采取追缴措施。这可能包括与当事人家属沟通、核实情况、要求退还违规领取的补助金等。
   • 如果当事人已死亡，且其遗产足以覆盖违规领取的补助金，那么应从其遗产中追缴。如果遗产不足或无法追缴，相关部门应依法采取其他措施，如向法院提起诉讼等。

4. 法律诉讼与判决：

   • 如果负责发放补助金的部门未能有效追缴违规资金，检察机关可以依法向法院提起行政公益诉讼，请求判令相关部门继续履行追缴职责。
   • 法院在审理此类案件时，会依据相关法律法规和事实情况，作出公正判决。如案例中所示，法院可能判决相关部门在规定期限内依法履行追缴职责，追缴剩余的违规发放补助金。

三、案例分析

以您提供的案例为例，某县人民检察院在履职中发现该县民政局存在违规行为：在县内48名城乡低保对象死亡后，民政局仍继续向其发放最低生活保障金。发现问题后，县检察院依法向县民政局发出检察建议，要求其对违规发放的保障金依法进行处理。虽然民政局采取了部分追缴措施，但仍有部分资金未追回。最终，法院判决民政局在规定期限内依法履行追缴职责。

四、建议与启示

1. 加强信息管理：

   • 相关行政机关应建立健全信息管理系统，确保及时、准确地掌握补助金领取者的生存状态和资格变化。

2. 强化动态监管：

   • 加强对补助金发放过程的动态监管，定期进行审核和审计，及时发现并纠正违规行为。

3. 提升法律意识：

   • 加强对公众的法律宣传和教育，提升其对社会救助资金管理和使用的法律意识，共同维护国家资金安全和制度公正。

综上所述，对于违规领取补助金且当事人已死亡的情况，相关行政机关应依法进行追缴，并采取有效措施确保国家利益不受损害。同时，公众也应依法依规申领社会保障待遇，共同守护国家资金安全和制度公正。