结论前置：逾期3个月以上扣款优先抵扣本金的法律依据，需结合合同约定、法律条款及司法实践综合判断，具体分为以下两种情况：
1. 合同有明确约定时，优先适用合同条款
根据《民法典》第465条：“依法成立的合同，受法律保护。当事人应当按照约定履行义务。”
- 核心逻辑：若借款合同、信用卡协议等文件中明确约定“逾期超过一定期限后，还款顺序为先本金后利息/费用”，则双方需按合同执行。
- 典型场景：部分银行信用卡章程或网贷平台协议中会规定，逾期90天（3个月）以上时，还款优先冲抵本金。
- 风险提示：若合同未明确约定，则不能直接主张“优先扣本金”，需依赖其他法律依据。
2. 合同无约定时，法律未强制规定还款顺序，但司法实践倾向保护本金
目前中国法律（如《民法典》合同编、民间借贷司法解释）未直接规定“逾期3个月以上必须优先扣本金”，但司法实践中存在以下倾向：
- 本金优先的合理性：本金是借款的核心，利息/违约金属于从属性债务。逾期时间越长，债务人偿债能力可能越弱，优先保障本金回收符合公平原则。
- 类案参考：部分法院在判决中会调整还款顺序，例如要求先冲抵本金，再计算利息/违约金，尤其是当债务人已陷入严重逾期时。
- 例外情形：若利息/违约金计算合法（未超过LPR四倍），且合同无相反约定，债权人可能主张按“费用→利息→本金”顺序扣款，此时需通过诉讼由法院裁决。
实务建议
- 核查合同条款：优先查看借款合同、信用卡章程等文件是否明确约定逾期后的还款顺序。
- 协商调整：若合同未约定，可与债权人协商达成补充协议，明确“逾期3个月以上优先扣本金”。
- 诉讼策略：若协商无果且涉及诉讼，可主张“本金优先”的公平性，并提供类似判例支持。
提示：法律未强制规定“逾期3个月必须优先扣本金”，但合同约定和司法实践可能支持这一操作。如有具体案件，建议提供合同文本进一步分析。