二审时原告撤回起诉以新案由起诉，一般不属于重复起诉，但需根据具体案件情况判断。以下从不同角度为您详细分析：

一、一般规则：撤诉后原告有权以新案由再次起诉

根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》的相关规定，原告撤诉或者人民法院按撤诉处理后，其诉权依然存在。这意味着，原告在撤诉后，有权以新的案由再次提起诉讼，且法院原则上应予受理。这是因为撤诉仅意味着原告暂时放弃了本次诉讼程序，而并非对其诉权的永久剥夺。在二审阶段撤回起诉后，若原告以新的案由重新起诉，只要该新案由具有合法性和合理性，且符合起诉条件，法院通常会受理。

二、特殊情形：可能构成重复起诉的情况

尽管一般情况下撤诉后原告有权以新案由再次起诉，但在某些特殊情况下，这种行为可能构成重复起诉。具体来说，如果后诉与前诉在当事人、诉讼标的、诉讼请求等方面存在高度一致性，或者后诉的诉讼请求实质上否定了前诉的裁判结果，那么可能构成重复起诉。不过，在您所描述的情形中，由于原告是以新的案由起诉，这通常意味着诉讼标的或诉讼请求发生了实质性变化，因此一般不构成重复起诉。但需注意，如果新案由与旧案由在实质上并无差异，或者只是对旧案由的简单变通，那么仍有可能被认定为重复起诉。

三、重复起诉的判断标准

要准确判断二审时原告撤回起诉以新案由起诉是否构成重复起诉，需综合考量以下关键因素：

1. 起诉主体的一致性：两次起诉的当事人必须保持一致。如果原告在撤诉后更换了当事人，或者加入了新的当事人，那么这可能影响对重复起诉的判断。
2. 诉讼标的的同一性：虽然原告以新的案由起诉，但需判断新案由与旧案由在诉讼标的上是否具有同一性。如果诉讼标的发生了实质性变化，那么一般不构成重复起诉。
3. 诉讼请求的实质相同性：需判断后诉的诉讼请求是否等同于甚至明确否定了前诉的判决结果。如果后诉的诉讼请求与前诉存在实质性差异，那么一般不构成重复起诉。
4. 案件事实的变化：如果撤诉后出现了新的事实或理由，如发现了新的决定性证据或相关法律发生了变化，导致原诉求有了新的法律依据，那么再次起诉不属于重复起诉。

四、法律建议

1. 确保新案由的合法性和合理性：原告在以新案由起诉时，应确保该新案由具有合法性和合理性，避免因为案由不当而被法院驳回起诉。
2. 准备充分的证据材料：无论以何种案由起诉，原告都应准备充分的证据材料来支持自己的诉讼请求。这有助于提高诉讼的成功率。
3. 咨询专业律师：由于法律问题具有复杂性和专业性，原告在起诉前应咨询专业律师的意见。律师可以根据具体案件情况为原告提供准确的法律建议和指导。

举例说明：假设在一起合同纠纷案件中，原告在一审阶段以“违约责任”为由起诉被告，但在二审阶段撤回起诉。之后，原告发现新的证据表明被告存在欺诈行为，于是以“欺诈”为由重新起诉被告。在这种情况下，由于新案由与旧案由在诉讼标的和诉讼请求上存在实质性差异，且原告准备了新的证据材料来支持自己的诉讼请求，因此一般不构成重复起诉。

综上所述，二审时原告撤回起诉以新案由起诉一般不属于重复起诉，但需根据具体案件情况判断。如果您在此方面遇到法律问题，可以直接向我咨询。