员工工资已经支付的情况下，一般不可以约定收回。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、法律原则角度

根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这一规定体现了劳动法对劳动者权益的保护，确保劳动者在付出劳动后能够获得相应的经济回报。因此，从法律原则上看，已经支付的工资，用人单位无权随意收回。

二、合同约定角度

1. 有效约定：如果劳动合同或相关协议中明确约定了工资支付后可以在特定条件下收回（如劳动者违反公司规定造成重大损失等），并且这种约定不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么从合同约定的角度来看，用人单位在符合约定条件的情况下可能有权收回部分或全部工资。但这种情况非常特殊且罕见，因为通常工资支付是单向的、不可逆的。

2. 无效约定：如果劳动合同或相关协议中的约定违反了法律、行政法规的强制性规定（如约定工资可以无条件收回），或者违背了公序良俗（如约定因劳动者个人原因离职就收回全部工资），那么这种约定是无效的。用人单位不能依据无效的约定来收回已经支付的工资。

三、实际操作角度

在实际操作中，用人单位很少会尝试收回已经支付的工资。因为这样做不仅可能违反法律规定，还可能引发劳动争议和纠纷，对用人单位的声誉和劳动关系造成负面影响。如果用人单位确实认为需要收回部分工资（如因劳动者过错造成损失），通常会通过协商、调解或法律途径来解决，而不是直接单方面收回工资。

四、法律后果角度

如果用人单位未经劳动者同意擅自收回已经支付的工资，劳动者有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁、诉讼等法律程序来维护自己的合法权益。在这种情况下，用人单位可能需要承担返还工资、支付赔偿金等法律责任。

建议：

• 对于用人单位而言，应当严格遵守劳动法律法规，按时足额支付劳动者工资，避免因违法操作而引发劳动争议和纠纷。
• 对于劳动者而言，如果遇到用人单位擅自收回工资的情况，应当及时向劳动监察部门投诉或寻求法律援助来维护自己的合法权益。

如果有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。