若在劳动仲裁时公司表示不再履行劳动关系，劳动者可采取以下措施来维护自己的合法权益：
确认仲裁裁决的生效情况：
- 首先，需要确认劳动仲裁裁决是否已经生效。若公司在法定期间内未向法院提起诉讼，则仲裁裁决即生效，具有法律效力，公司必须履行。
准备强制执行申请材料：
- 若公司拒绝履行生效的仲裁裁决，劳动者应准备强制执行申请书、生效的仲裁裁决书以及申请人的身份证明（如身份证复印件）等材料。
- 强制执行申请书应详细写明申请人和被申请人的信息、申请执行的事项、事实与理由等内容。
向有管辖权的法院申请强制执行：
- 劳动者应向被执行人（即公司）住所地或被执行的财产所在地的基层人民法院申请强制执行。
- 法院在受理申请后，会向公司发出执行通知，责令其在规定期限内履行义务。
配合法院执行工作：
- 若公司仍拒不履行，法院有权采取多种强制执行措施，如查询、冻结、划拨公司的银行存款；查封、扣押、拍卖、变卖公司的财产等。
- 劳动者应积极配合法院的执行工作，提供公司的财产线索，以便法院更顺利地实现劳动者的权益。
追究公司的法律责任：
- 若公司及相关责任人拒不执行仲裁裁决，法院有权依法对其采取罚款、拘留等强制措施。
- 情节严重构成犯罪的，如拒不执行判决、裁定罪，相关责任人将依法被追究刑事责任。
其他辅助措施：
- 向劳动监察部门反映：劳动者可向当地劳动监察部门反映公司拒不履行的情况，以获得其监督和督促。
- 媒体曝光：在合法合规的前提下，劳动者可通过媒体对公司行为进行曝光，借助舆论压力促使其履行义务。但需确保信息真实客观，避免侵犯公司合法权益。
- 追加公司股东为被执行人：在特定情形下，如公司股东存在未足额出资、抽逃出资等违法行为且影响公司履行义务的，劳动者可申请追加股东为被执行人。
在处理过程中，劳动者还需注意以下几点：
- 时效问题：申请强制执行的期限一般为裁决生效后的两年内，劳动者需特别注意这一时效问题，以免错过申请时机。
- 证据收集：劳动者在申请强制执行前应充分收集相关证据，如仲裁裁决书、公司拒不履行的证据等，以支持自己的申请。
- 法律咨询：在整个过程中，劳动者若有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。
综上所述，当公司在劳动仲裁时表示不再履行劳动关系时，劳动者可通过申请强制执行、追究法律责任以及其他辅助措施来有效维护自己的权益。