发包人审批竣工付款申请单的期限主要依据《建设工程施工合同（示范文本）》及《建设工程价款结算暂行办法》的相关规定，具体分析如下：

1. 《建设工程施工合同（示范文本）》中的规定
   根据《建设工程施工合同（示范文本）》（GF-2017-0201）第14.2条，发包人应在收到承包人提交的竣工结算申请单后14天内完成审批，并向承包人出具竣工结算证书。若发包人逾期未完成审批，视为已认可承包人提交的竣工结算申请单。这一条款明确了发包人审批的期限及逾期后果，为双方提供了明确的操作指引。

2. 《建设工程价款结算暂行办法》中的规定
   根据《建设工程价款结算暂行办法》（财建〔2004〕369号）第14条，工程竣工结算报告金额在不同范围内的，发包人审查时间有所不同：

   • 500万元以下：从接到竣工结算报告和完整的竣工结算资料之日起20天；
     
   • 500万元至2000万元：从接到竣工结算报告和完整的竣工结算资料之日起30天；
     
   • 2000万元至5000万元：从接到竣工结算报告和完整的竣工结算资料之日起45天；
     
   • 5000万元以上：从接到竣工结算报告和完整的竣工结算资料之日起60天。
     该办法针对不同规模的工程，设定了差异化的审批期限，体现了对工程复杂性和金额规模的考量。

总结与建议：
发包人审批竣工付款申请单的期限需结合合同约定与部门规章综合判断。若合同中已明确审批期限（如示范文本的14天），则优先适用合同约定；若合同未约定，则可参照《建设工程价款结算暂行办法》中根据工程金额确定的期限。建议承包人在提交申请单时，明确要求发包人按约定或法定期限完成审批，并保留相关证据，以避免因期限问题产生纠纷。

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