单位的员工内部承建工程合同是否有效，需结合具体情况判定，以下从不同角度进行分析：
有效情形
- 主体合法：若承包人与单位存在合法的劳动关系，即承包方是单位内部员工，这符合内部承包的主体要求。例如，某建筑公司与其正式员工签订内部承建工程合同，该员工具备相应的施工管理能力，且与公司存在长期稳定的劳动关系。
- 单位实质管理：单位对项目进行实质性管理，涵盖技术、质量、安全等方面，体现公司对项目的掌控。比如，在项目施工过程中，建筑公司定期派专业人员到现场进行技术指导、质量检查和安全监督，确保工程按照规范和标准进行。
- 内容合法：合同内容不违反法律法规的强制性规定，不损害国家、集体和第三人利益。合同条款明确双方在项目中的权利义务，如工程范围、工期、质量标准、价款支付方式等，且符合相关法律法规的要求。在这种情况下，合同体现了公司内部的管理和经营模式，是双方真实意思表示，应认定有效。
无效情形
- 挂靠行为：若承包人不具备劳动关系，属于借用资质的外部人员，以内部承包之名行挂靠之实，违反建筑法等相关法律规定，破坏了建筑市场秩序，合同会被认定无效。例如，某个人没有相应的施工资质，通过与建筑公司签订内部承包合同的方式，借用公司的资质承揽工程，实际施工由该个人组织团队进行。
- 单位未实质管理：单位未进行实质性管理，只收取管理费，对工程质量、安全等问题放任不管。比如，建筑公司签订内部承包合同后，仅在形式上收取一定比例的管理费，而不参与项目的实际管理，不提供技术、质量、安全等方面的支持和监督。
- 内容违法：合同内容违反法律法规强制性规定，如违反招投标程序等。例如，某工程应通过公开招投标的方式确定承包人，但单位与内部员工签订内部承包合同时，未按照规定进行招投标，直接将工程承包给该员工。
法律后果
- 有效合同的后果：若合同有效，双方应按照合同约定履行各自的义务。单位应按照约定支付工程价款，提供必要的技术支持和协调工作；承包人应按照合同要求完成工程建设，保证工程质量和工期。如果一方违约，应承担相应的违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。
- 无效合同的后果：
- 工程验收合格：若工程验收合格，实际施工人（即承包人）可参照合同约定主张价款。这是因为实际施工人已经完成了工程建设，且工程质量符合要求，从公平原则出发，应给予其相应的报酬。
- 工程验收不合格：若工程验收不合格且修复后仍不合格，承包人请求支付价款将不予支持。这是因为承包人未能按照合同要求完成合格的工程建设，单位有权拒绝支付价款，且承包人可能还需要承担因工程不合格给单位造成的损失。
建议：单位在与员工签订内部承建工程合同时，应确保承包人具备合法的劳动关系，对项目进行实质性管理，合同内容合法合规。同时，在合同履行过程中，双方应严格按照合同约定履行各自的义务，避免出现违约行为。如果对合同的效力或履行存在疑问，可以直接向我咨询。