针对您提出的“在建工程流拍后，同时存在建设工程优先受偿权及土地抵押权应如何处置”的问题，这是一个涉及法律权利竞合的复杂情形，需要我们从法律条文、司法实践以及权利性质等多个角度进行综合分析。
一、法律条文基础
首先，我们明确两个核心法律概念：
建设工程价款优先受偿权：根据《民法典》第八百零七条，发包人未按照约定支付价款的，承包人可以催告发包人在合理期限内支付价款。发包人逾期不支付的，除根据建设工程的性质不宜折价、拍卖外，承包人可以与发包人协议将该工程折价，也可以请求人民法院将该工程依法拍卖。建设工程的价款就该工程折价或者拍卖的价款优先受偿。
抵押权：根据《民法典》第四百一十条，债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的实现抵押权的情形，抵押权人可以与抵押人协议以抵押财产折价或者以拍卖、变卖该抵押财产所得的价款优先受偿。
二、权利竞合时的处理原则
当在建工程上同时存在建设工程价款优先受偿权和土地抵押权时，根据司法实践和相关法律规定，建设工程价款优先受偿权通常优先于抵押权。这一原则主要基于以下几点：
法定优于约定：建设工程价款优先受偿权是法律直接规定的，具有法定性，不以当事人事先存在特别约定为必要。而抵押权是当事人合意设定。在同一建设工程上存在两者竞合时，法定优先优于约定优先。
权利根源与物质基础：承包人的建设工程价款优先权基于其垫付资金购买材料、支付工人报酬建造而成，权利产生于原始取得方式。而抵押权依赖于承包人的建造行为，如无承包人的建造，抵押物不会存在，抵押权将失去行使的物质基础。
保护对象与立法宗旨：工程价款优先权保护的是广大建筑工人的利益，这些工人是社会财富的直接创造者。保护他们的利益，有利于社会财富的创造和社会的稳定。而抵押权保护的是债权人的利益，相对于建筑工人的利益来说，后者在立法上得到了更优先的保护。
三、具体处置建议
协商与调解：在流拍后，相关权利人（包括承包人、抵押权人等）可以首先尝试通过协商或调解的方式，就工程折价或拍卖价款的分配达成一致。
法律程序：若协商无果，相关权利人可以依法向人民法院提起诉讼或申请执行，由法院根据法律规定和案件具体情况，确定工程折价或拍卖价款的分配顺序和比例。
注意权利行使期限：承包人行使优先受偿权应在法定期限和合理范围内行使，避免因超过期限而丧失权利。
审查放弃优先受偿权的协议：若开发商在签订建设工程施工合同时要求承包人签署放弃优先受偿权协议书，应审查该协议是否损害建筑工人的利益。若损害，则该放弃行为可能不被法院支持。
综上所述，当在建工程流拍后同时存在建设工程优先受偿权及土地抵押权时，应优先保障建设工程价款优先受偿权的实现。相关权利人应通过合法途径维护自己的权益，并遵循法律规定的权利行使顺序和原则。