两班倒工作制（12小时）通常是不合法的。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律规定的工作时间

根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。这意味着，在正常情况下，劳动者每日的工作时间不应超过8小时，每周不应超过44小时。而两班倒工作制（12小时）明显超出了这一法定工作时间限制。

二、加班时间的限制

虽然《中华人民共和国劳动法》第四十一条规定，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，但一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。两班倒工作制（12小时）意味着劳动者每日工作时间远超出了这一加班时间的限制，即使考虑到可能的休息时间，也很难符合每月加班时间不超过三十六小时的规定。

三、特殊工时制度的适用

当然，也存在一些特殊情况。《中华人民共和国劳动法》第三十九条规定，企业因生产特点不能实行本法第三十六条、第三十八条规定的，经劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法。但这并不意味着企业可以随意延长劳动者的工作时间。即使实行特殊工时制度，也需要确保劳动者的休息权益得到保障，且必须经过劳动行政部门的批准。未经批准擅自实行两班倒工作制（12小时）仍然是违法的。

四、违法后果及建议

如果企业违反了上述法律规定，实行了两班倒工作制（12小时），劳动者有权向劳动监察部门投诉，要求企业纠正违法行为，并可能获得相应的赔偿。同时，我也建议企业在制定工时制度时，应严格遵守国家法律法规，确保劳动者的合法权益得到保障。如果确实需要延长工作时间，应与工会和劳动者充分协商，并确保加班时间在法律允许的范围内。

总结来看，两班倒工作制（12小时）在大多数情况下是不合法的。企业在制定工时制度时，应严格遵守国家法律法规，确保劳动者的合法权益得到保障。如果您在工作中遇到了类似的问题，或者有任何法律方面的疑问，都可以直接向我咨询。