结论前置：老板以规章制度为由扣发工资的行为是否合法，需结合规章制度内容、制定程序及扣款合理性综合判断。以下分情况说明：
1. 若规章制度本身违法或制定程序不合法
根据《劳动合同法》第四条，用人单位制定涉及劳动者切身利益的规章制度（如工资扣减）时，需经民主程序（如职工代表大会讨论）并公示告知劳动者。若规章制度未履行上述程序，或内容违反法律强制性规定（如扣款后工资低于当地最低工资标准），则该条款无效，老板无权据此扣款。
建议：要求老板出示规章制度原文及制定程序证明（如会议记录、公示照片），若无法提供，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，主张补发工资。
2. 若规章制度合法，但扣款金额超出法定比例
根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按劳动合同约定要求赔偿，但每月扣款不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。
示例：若月工资5000元，老板最多可扣1000元（20%），且剩余4000元需高于当地最低工资（如2280元）。若扣款超过比例，属于违法。
建议：核对工资条中的扣款明细，计算是否超标。若超标，可要求老板补足差额，或通过劳动仲裁维权。
3. 若扣款理由与规章制度不符，或存在“变相克扣”
部分老板可能以“规章制度”为名，行克扣工资之实（如以“绩效不达标”“工作态度差”等主观理由扣款，但未在合同或制度中明确）。此类行为缺乏法律依据，属于未及时足额支付劳动报酬，劳动者可依据《劳动合同法》第三十八条解除劳动合同，并主张经济补偿金（工作每满1年支付1个月工资）。
建议：保留工资条、考勤记录、沟通记录等证据，证明扣款无合理依据。若协商无果，可向劳动监察大队举报或直接申请仲裁。
4. 特殊情形：疫情期间或不可抗力因素
若因疫情等不可抗力导致经营困难，用人单位可与劳动者协商延期支付工资，但需经工会或职工代表同意，并报劳动部门备案。若未经协商单方面扣款，仍属违法。
建议：要求老板出具书面协商记录或政府备案文件，若无法提供，可按上述流程维权。
行动建议：
提示：工资扣减问题涉及劳动法、合同法等多部法律，具体操作需结合个案细节。如有疑问，可直接向我提供更多信息（如扣款原因、制度条款等），我会进一步分析。