结论：工程结束后工人在等待工资期间发病，老板是否承担责任需视具体情况而定，包括发病原因、工作性质、劳动合同及法律规定等因素。
一、发病原因与工作性质的关系
若发病与工作直接相关：
- 如果工人的发病是由于工作过程中受到的伤害或职业病导致的，那么根据《工伤保险条例》等相关法律法规，工人有权享受工伤保险待遇，老板（或用人单位）需要承担相应的责任。这包括支付医疗费用、停工留薪期间的工资福利等。
若发病与工作无直接关联：
- 如果工人的发病是由于个人健康原因，如突发疾病、旧病复发等，且与工作无直接关联，那么老板通常不需要承担直接的医疗费用责任。但老板仍需按照劳动合同和法律规定，支付工人应得的工资和福利。
二、劳动合同与工资支付
劳动合同约定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。如果老板未按时支付工资，工人有权要求老板支付，并可能要求支付逾期利息或赔偿金。
工资支付义务：
- 无论工人是否发病，老板都有义务按照劳动合同的约定支付工资。如果工人因发病无法工作，老板可能需要根据实际情况和劳动合同的约定，决定是否支付病假工资或医疗期工资。
三、老板可能承担的责任
民事责任：
- 如果老板未按时支付工资，工人可以通过法律途径追究老板的民事责任，要求支付工资及可能的赔偿金。
行政责任：
- 如果老板的行为违反了劳动法律法规，如未按时支付工资、未提供劳动保护条件等，劳动行政部门可以对其处以罚款等行政处罚。
刑事责任（极端情况）：
- 在极端情况下，如果老板的行为构成拒不支付劳动报酬罪等犯罪行为，可能需要承担刑事责任。但这通常需要满足一定的条件，如恶意拖欠工资、数额较大等。
四、建议与措施
收集证据：
- 工人应收集与工作、工资支付相关的证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以备不时之需。
与老板协商：
- 在发病期间，工人可以尝试与老板协商，要求支付工资和可能的医疗费用。如果协商无果，可以考虑寻求法律援助。
寻求法律援助：
- 如果工人认为自己的权益受到侵害，可以寻求法律援助或咨询专业律师，了解自己的权利和可能的救济途径。
总结：工程结束后工人在等待工资期间发病，老板是否承担责任需根据具体情况判断。如果发病与工作直接相关，老板可能需要承担工伤保险责任；如果与工作无直接关联，老板仍需按照劳动合同和法律规定支付工资。在任何情况下，工人都有权要求老板按时支付工资，并可以通过法律途径维护自己的权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。