商铺拆迁修学校但不办理房产证的行为，其合法性需根据具体情况判断，但通常情况下，不办理房产证可能涉及违法问题。以下从不同角度进行分析：

一、拆迁合法性角度

1. 拆迁程序合法性：

   • 商铺拆迁修学校，首先需确保拆迁程序合法。这包括拆迁方是否取得了合法的拆迁许可证，是否按照法定程序进行了公告、评估、协商等步骤。
   • 如果拆迁程序不合法，如未取得拆迁许可证或未按照法定程序进行，那么拆迁行为本身就可能违法，此时不办理房产证更是加剧了违法性。

2. 拆迁补偿合法性：

   • 拆迁方应依法对被拆迁商铺进行合理补偿，包括房屋价值补偿、搬迁费用补偿等。
   • 如果拆迁方未依法进行补偿，或者补偿标准明显低于市场价值，被拆迁方有权拒绝拆迁或要求增加补偿。在此情况下，不办理房产证可能构成对被拆迁方权益的进一步侵害。

二、房产证办理角度

1. 房产证办理义务：

   • 根据相关法律法规，拆迁后新建的房屋（包括学校）应依法办理房产证。这是房屋所有权人的法定权利，也是房屋合法存在的证明。
   • 如果拆迁方或建设方未依法办理房产证，可能构成违法违规行为，需要承担相应的法律责任。

2. 不办理房产证的后果：

   • 不办理房产证可能导致房屋所有权不明确，影响房屋的合法使用和转让。
   • 对于学校而言，如果未办理房产证，可能影响其作为教育机构的合法性和稳定性，甚至可能面临被责令停办或拆除的风险。

三、法律建议

1. 核实拆迁程序：

   • 被拆迁方应核实拆迁方是否取得了合法的拆迁许可证，并按照法定程序进行了拆迁。
   • 如果发现拆迁程序不合法，应及时向相关部门举报并寻求法律援助。

2. 要求依法补偿：

   • 被拆迁方应要求拆迁方依法进行补偿，并确保补偿标准合理、公平。
   • 如果对补偿标准有异议，可以通过协商、调解或诉讼等方式解决。

3. 督促办理房产证：

   • 被拆迁方或学校建设方应督促相关部门或建设单位依法办理房产证。
   • 如果相关部门或建设单位拒绝办理或拖延办理，可以向房地产管理部门投诉或寻求法律援助。

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