针对女方为避免做亲子鉴定而选择独自抚养孩子的情况，男方可以采取以下措施：
法律途径确认亲子关系：
- 提起亲子关系确认之诉：男方有权向法院提起诉讼，请求确认与孩子之间的亲子关系。在此过程中，法院可能会根据具体情况，要求女方或孩子配合进行亲子鉴定。若女方拒绝配合，且没有其他充分证据证明亲子关系不存在，法院可能会依据现有证据和法律规定，作出对男方有利的判决。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，对亲子关系有异议且有正当理由的，父或者母可以向人民法院提起诉讼，请求确认或者否认亲子关系。
收集并保留证据：
- 收集间接证据：在提起诉讼前或诉讼过程中，男方应尽可能收集与孩子之间的间接证据，如共同生活的照片、视频、聊天记录、证人证言等，这些证据虽不能直接证明亲子关系，但可以在一定程度上辅助证明男方与孩子之间的亲密关系。
- 保留相关证据：男方应妥善保管所有与孩子相关的证据，包括但不限于出生证明、医疗记录、教育记录等，这些证据可能在后续的法律程序中发挥重要作用。
考虑孩子的利益：
- 以孩子利益为重：在处理此类纠纷时，男方应始终将孩子的利益放在首位。无论最终亲子关系是否得到确认，都应尽量减少对孩子的伤害和影响。
- 寻求专业帮助：若男方在处理过程中遇到困难或不确定如何操作，可以寻求专业律师或心理咨询师的帮助，以确保自己的权益得到保障，同时尽量减少对孩子的负面影响。
协商与调解：
- 尝试协商：在提起诉讼前，男方可以尝试与女方进行协商，看是否能够达成一致意见，如共同进行亲子鉴定或协商孩子的抚养权等。
- 参与调解：若协商无果，男方可以寻求第三方调解机构的帮助，如社区调解委员会、人民调解委员会等，通过调解的方式解决纠纷。
在处理此类纠纷时，男方需要注意以下几点：
- 保持冷静和理性：避免因情绪激动而做出过激行为，这可能对案件处理产生不利影响。
- 遵循法律程序：严格按照法律程序进行操作，不要试图通过非法手段解决问题。
- 及时咨询专业律师：在处理过程中遇到任何法律问题或不确定如何操作时，应及时咨询专业律师的意见。
若男方决定采取法律途径解决纠纷，建议按照以下步骤进行：
- 收集并整理相关证据；
- 撰写起诉状并提交至法院；
- 参加法院组织的庭审活动；
- 根据法院判决结果执行相应义务或享有相应权利。
最后需要强调的是，每个案件的具体情况都有所不同，男方在处理此类纠纷时应根据自己的实际情况和法律规定来制定合适的策略。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。