员工向仲裁发了调解书后，公司应当按照调解协议来履行各自的义务，这是具有法律效力的文件所要求的。具体来说，公司可以从以下几个方面来处理：

1. 履行调解协议：

   • 劳动仲裁调解书一旦生效，就具有法律约束力，双方都必须严格按照调解协议来履行各自的义务。对于公司而言，如果调解书中明确了公司需要支付的金额（如工资、经济补偿等）和时间，那么公司就必须在规定的时间内完成支付。
   • 举例：假设调解书中规定公司应在某日前支付员工拖欠的工资共计5000元，那么公司就必须在这个日期前将5000元支付给员工。

2. 保存好相关凭证：

   • 公司应当妥善保存劳动仲裁调解书的原件，以及调解协议履行过程中产生的各类证据，如支付记录、工作交接记录等。这些证据在后续可能出现纠纷时，能够发挥重要作用，证明公司已经按照调解协议履行了义务。
   • 举例：如果公司在支付工资后，没有保留支付凭证，而员工后来又声称公司未支付，那么此时公司就可能因为缺乏证据而陷入被动。

3. 关注对方履行情况：

   • 公司不仅要自己履行调解协议，还要时刻留意员工是否按照调解书约定的时间和内容履行了义务。如果发现员工有未履行的情况，公司应及时与员工沟通协商，寻求解决方案。
   • 举例：如果调解书中规定员工应在某日前完成工作交接，但员工到期未交接，那么公司应及时与员工沟通，了解原因并协商解决方案。

4. 应对不履行的情况：

   • 如果公司不履行调解协议中的支付义务等相关内容，员工有权向法院申请强制执行。法院会采取一系列措施来强制公司履行义务，如查询公司的银行账户、冻结资金、划拨款项等。
   • 举例：如果公司拖欠员工工资，在调解书中明确了支付金额和时间，但到期却未支付，员工就可以拿着调解书去法院申请强制执行。

5. 加强人事管理和法律风险防范：

   • 此次调解书的履行也是公司加强人事管理和法律风险防范的一个契机。公司应当借此机会，完善相关管理制度，规范用工行为，降低未来发生劳动争议和法律风险的可能性。
   • 举例：公司可以加强劳动合同管理，确保所有员工都签订了书面劳动合同，并明确双方的权利和义务；同时，公司还可以加强员工培训，提高员工的法律意识和合规意识。

如果公司在处理过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询。我会根据公司的具体情况，提供专业的法律意见和解决方案。