当建设单位（这里可能指的是总包单位将工程分包给的具体施工方，如包工头或分包公司）跑路时，分包单位（若您指的是总包单位下进一步分包的单位，或直接受总包管理的分包情况，以下以总包单位视角结合分包责任进行解答）需要采取一系列措施来妥善处理这一问题，特别是当涉及到农民工工资等关键问题时。以下是一些具体的处理步骤和建议：

1. 梳理合同与款项支付情况

• 合同审查：首先，分包单位（或总包单位，视具体情况而定）需要仔细审查与跑路的建设单位（或包工头）之间的合同，明确双方的权利和义务，特别是关于工程款支付、工期、质量等方面的条款。
• 款项支付核查：同时，核查已支付的款项和未结清的工程款，确定是否达到付款条件，以及是否存在未支付的农民工工资等关键问题。

2. 承担农民工工资清偿责任

• 工资统计与支付：根据相关规定，如《保障农民工工资支付条例》，分包单位（或总包单位）对农民工工资有先行清偿的责任。因此，应立即统计被拖欠的农民工工资数额，并从应付给跑路建设单位的款项中优先支付。如果款项不足，分包单位（或总包单位）需要垫付。
• 法律责任：不履行这一责任可能会导致法律纠纷和信誉损失，因此必须高度重视。

3. 收集证据并维权

• 证据收集：积极收集跑路建设单位的相关证据，如合同、结算单、工人证言、转账记录等，这些证据将用于后续的法律维权。
• 法律途径：通过法律途径追究跑路建设单位的违约责任。如果涉及犯罪行为，如诈骗、挪用资金等，应立即向公安机关报案。

4. 安抚工人与防止群体事件

• 工人安抚：在处理过程中，要积极与农民工沟通，解释当前的情况和处理措施，安抚他们的情绪，防止发生群体事件。
• 依法依规处理：在整个处理过程中，必须严格遵循法律法规和相关政策要求，保障各方的合法权益，维护建筑市场的秩序。

5. 后续追偿与风险防范

• 追偿权行使：在先行清偿农民工工资后，分包单位（或总包单位）可以依法向跑路的建设单位进行追偿，要求其承担相应的法律责任和经济损失。
• 风险防范：为了避免类似情况再次发生，分包单位（或总包单位）应加强对分包方的资质审查和管理，确保分包方具备合法的用工主体资格和良好的信誉记录。

6. 寻求专业法律支持

• 在处理此类复杂问题时，建议寻求专业法律人士的支持和指导，以确保处理措施的合法性和有效性。

综上所述，当建设单位跑路时，分包单位（或总包单位）需要迅速采取行动，梳理合同与款项支付情况、承担农民工工资清偿责任、收集证据并维权、安抚工人与防止群体事件、行使追偿权与加强风险防范，并在必要时寻求专业法律支持。