旷工扣三天工资是否按计时工资算，需结合单位规章制度及劳动合同约定来判断，但核心原则是扣除的工资应与旷工行为直接相关，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。以下从不同角度为您详细分析：

一、按计时工资计算的情况

若单位采用计时工资制，且规章制度或劳动合同中明确规定旷工按计时工资标准扣除，则旷工三天的工资扣除通常按计时工资计算。例如：

• 计算公式：日工资 = 月工资 ÷ 21.75天（月计薪天数）
• 示例：若员工月工资为5000元，则日工资约为230元。旷工三天，单位可能扣除690元（230元/天 × 3天）。

法律依据：根据《工资支付暂行规定》，用人单位应依法制定规章制度，明确旷工等违纪行为的处理方式。若规章制度或劳动合同中约定按计时工资扣除旷工工资，且该制度已依法公示，则单位有权按此执行。

二、非计时工资计算的情况

若单位未采用计时工资制，或规章制度、劳动合同中未明确规定旷工按计时工资扣除，则扣除方式可能不同。例如：

• 按固定金额扣除：单位可能规定旷工一天扣除固定金额（如200元），旷工三天则扣除600元。
• 按比例扣除：单位可能规定旷工扣除当月工资的一定比例（如5%），具体金额需根据月工资计算。

关键点：无论采用何种扣除方式，均需满足以下条件：

1. 规章制度合法有效：单位应依法制定规章制度，并经民主程序讨论、公示。
2. 扣除后工资不低于最低工资标准：扣除旷工工资后，员工当月工资不得低于当地最低工资标准。

三、单位未依法制定或公示制度的后果

若单位未依法制定或公示关于旷工扣工资的规章制度，则随意扣除工资可能面临法律风险。例如：

• 员工维权途径：员工可先与单位协商，协商不成可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
• 法律后果：单位可能因违法扣除工资而被要求补发工资、支付赔偿金等。

示例：小朱在某单位工作，月工资3000元。单位未公示关于旷工扣工资的规章制度，却扣除小朱旷工三天的工资414元（按日工资138元计算）。小朱认为单位扣除工资不合理，双方产生争议。此时，小朱可要求单位提供合法有效的规章制度作为扣除依据，若单位无法提供，则扣除行为可能违法。

四、建议与总结

1. 查看单位规章制度：员工应首先查看单位关于旷工扣工资的规章制度，确认扣除方式是否合法、合理。
2. 与单位协商：若对扣除方式有异议，可先与单位协商，寻求解决方案。
3. 申请劳动仲裁：协商不成时，员工可向劳动仲裁委员会申请仲裁，维护自身合法权益。

总结：旷工扣三天工资是否按计时工资算，取决于单位规章制度及劳动合同约定。但无论如何扣除，均需满足合法性、合理性要求，且扣除后工资不得低于当地最低工资标准。若单位未依法制定或公示制度，则扣除行为可能违法。员工在遇到此类问题时，应积极维护自身权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询。