交警以协议来判定逃逸，主要是基于协议内容及相关证据来综合认定事故责任及逃逸行为。针对您提出的问题，我将从以下几个方面进行详细解答：
一、协议在交通事故处理中的作用
在交通事故处理中，协议通常作为双方就事故责任、赔偿等事项达成一致的书面文件。它有助于明确双方的权利和义务，减少后续纠纷。然而，协议本身并不能直接作为判定逃逸的依据，但协议中的内容（如事故发生经过、双方责任划分等）可能成为交警判定逃逸行为的重要参考。
二、逃逸行为的认定标准
根据相关法律法规及实践，逃逸行为的认定通常基于以下标准：
- 明知发生交通事故：交通事故当事人驾车或弃车逃离事故现场，且明知事故已经发生。
- 逃避法律责任：当事人试图通过逃离现场来逃避可能的法律责任，如赔偿、行政处罚或刑事处罚。
- 未履行现场听候处理义务：如报案后不履行现场听候处理义务，弃车离开事故现场后又返回的，也可能被认定为逃逸。
在您的案例中，如果协议中明确记载了事故发生经过，且显示您或您公司车辆在事故后未履行现场听候处理义务或试图逃避法律责任，那么交警可能据此认定存在逃逸行为。
三、交警扣车与协议的关系
交警扣车通常是为了调查事故原因、收集证据或确保赔偿得以实现。扣车行为本身并不直接决定逃逸的认定，但扣车期间交警可能会要求双方签订协议以明确责任。如果协议中涉及逃逸行为的描述或承认，那么这将成为交警判定逃逸的重要依据。
四、法律后果与建议
- 行政处罚：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十九条，造成交通事故后逃逸，尚不构成犯罪的，由公安机关交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款，可以并处十五日以下拘留。同时，根据该法第一百零一条，造成交通事故后逃逸的，由公安机关交通管理部门吊销机动车驾驶证，且终生不得重新取得机动车驾驶证。
- 刑事处罚：如果交通逃逸行为构成犯罪，那么将依法追究刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》第一百三十三条，交通运输肇事后逃逸或者有其他特别恶劣情节的，处三年以上七年以下有期徒刑；因逃逸致人死亡的，处七年以上有期徒刑。
建议：
- 积极配合调查：在事故发生后，应立即停车、保护现场、抢救伤员，并及时报警等待处理。积极配合交警部门的调查，如实陈述事故经过。
- 审慎签订协议：在签订任何与事故相关的协议前，务必仔细阅读协议内容，确保协议条款公平、合理，并明确双方的责任和义务。如有疑问，可咨询专业律师。
- 寻求法律帮助：如果您对交警的判定有异议或认为自己的权益受到侵害，可及时寻求法律帮助，通过合法途径维护自己的权益。
希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。