在入职时用的名字与真实名字不一致，申请劳动仲裁确实可能会有一定影响，但具体影响程度需分情况讨论：

1. 若入职时使用的名字与身份证等有效证件上的名字存在明显差异，且未进行合法变更或备案：

   • 影响：在申请劳动仲裁时，仲裁机构可能会要求提供与入职时使用的名字相一致的证据材料，如劳动合同、工资单等。若这些材料上的名字与真实名字不一致，且无法提供合法有效的变更或备案证明，仲裁机构可能会对证据的真实性产生质疑，从而影响仲裁结果。
   • 建议：在申请劳动仲裁前，应尽可能收集并整理与入职时使用的名字相一致的证据材料，并尝试通过合法途径（如向公安机关申请变更姓名、向用人单位出具证明等）解决名字不一致的问题。

2. 若入职时使用的名字与真实名字存在差异，但已通过合法途径进行变更或备案：

   • 影响：在这种情况下，只要能够提供合法有效的变更或备案证明，仲裁机构通常会认可入职时使用的名字与真实名字的一致性，因此不会对仲裁结果产生实质性影响。
   • 建议：在申请劳动仲裁时，应主动提供变更或备案证明，以证明入职时使用的名字与真实名字的一致性。

3. 若入职时使用的名字为笔误或昵称，且用人单位对此知情并认可：

   • 影响：在这种情况下，只要用人单位对入职时使用的名字知情并认可，且该名字在劳动合同、工资单等证据材料上得到体现，仲裁机构通常会认可其有效性，因此不会对仲裁结果产生实质性影响。
   • 建议：在申请劳动仲裁时，应提供用人单位对入职时使用的名字知情并认可的证据，如劳动合同、工资单、用人单位出具的证明等。

从法律背景来看，根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，申请劳动仲裁需要提供与争议事项相关的证据材料。若入职时使用的名字与真实名字不一致，且无法提供合法有效的变更或备案证明，可能会影响证据的真实性和有效性，从而影响仲裁结果。

因此，针对您的情况，我建议您：

• 尽快收集并整理与入职时使用的名字相一致的证据材料；
• 尝试通过合法途径解决名字不一致的问题，如向公安机关申请变更姓名、向用人单位出具证明等；
• 在申请劳动仲裁时，主动提供变更或备案证明以及用人单位对入职时使用的名字知情并认可的证据；
• 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。