针对您提出的“合作社在合作联社是股东可以注销吗”这一问题，以下是我的详细解答：
首先，要明确的是，合作社作为合作联社的股东，其本身是否可以注销，并非单纯由合作社作为股东的身份决定，而是取决于合作社自身的运营状况、股东意愿以及相关法律法规的规定。
一、合作社股东退出的方式
合作社股东想要退出，主要有两种方式：
股权转让：股东可以选择将其持有的股权转让给其他股东或外部人士。内部股权转让只需在合作社内部协商即可达成；对外转让则需要按照规定的程序通知合作社全体股东，并需获得半数以上股东的同意。
注销合作社：如果合作社决定不再继续经营，股东们也可以选择通过注销合作社的方式来实现退出。这一过程中，需要按照法定程序提交申请、准备相关资料，并在各个部门完成注销手续。
二、合作社注销的股东同意要求
关于合作社注销需要多少股东同意的问题，通常情况下，合作社注销需要全体股东一致同意。因为合作社是由全体股东共同设立并运营的经济组织，其注销涉及到众多方面的事务处理，如资产清算、债务清偿、社员权益安排等，这些都需要全体股东共同协商并达成一致意见。如果部分股东不同意注销，可能会导致注销程序无法顺利进行，甚至引发法律纠纷。
三、合作社注销股东不配合的处理
若在合作社注销过程中，有股东不配合，可采取以下措施：
沟通协商：首先应尽量与该股东进行沟通协商，了解其不配合的原因，尝试通过沟通解决问题，并明确告知其不配合可能导致的法律后果。
合法催告：若沟通无效，可依据合作社的章程及相关法律法规，通过合法程序对该股东进行催告，要求其在规定期限内配合注销事宜，逾期不配合将依法采取相应措施。
第三方调解：可寻求第三方调解机构的帮助，如工商行政管理部门等，让专业机构从中调解，促进双方达成共识。
法律诉讼：若经过上述努力仍无法解决问题，可向法院提起诉讼，请求法院判决该股东配合合作社注销，以维护合作社及其他股东的合法权益。
综上所述，合作社作为合作联社的股东，其本身是否可以注销，取决于合作社自身的运营状况、股东意愿以及相关法律法规的规定。在决定注销前，应充分了解相关法律法规和程序要求，并确保所有股东的意愿得到充分尊重和考虑。