在刑事案件中，如果公安机关认为无罪，检察院是否会起诉，需要分情况讨论：
公安机关认为无罪，且证据确实、充分支持无罪结论：
- 在这种情况下，公安机关在侦查终结后，会认为案件不符合起诉条件，从而作出撤销案件的决定。此时，案件不会进入检察院审查起诉阶段，检察院自然也就不会起诉。
公安机关认为无罪，但证据存在疑问或不足：
- 公安机关在侦查过程中，如果发现证据不足以支持有罪结论，但也不能完全排除犯罪嫌疑，可能会将案件移送检察院审查起诉，同时附上相关证据和侦查情况说明。
- 检察院在收到案件后，会进行全面审查。如果检察院认为证据确实、充分，足以支持起诉，即使公安机关最初认为无罪，检察院也可能决定起诉。
- 反之，如果检察院也认为证据不足，不符合起诉条件，会作出不起诉决定。
公安机关与检察院对案件性质存在分歧：
- 在某些情况下，公安机关和检察院可能对案件的性质、证据的认定等存在分歧。公安机关可能认为无罪，而检察院在审查后可能认为有罪，从而决定起诉。
- 这种情况下，检察院会依据自己的审查结果和法律规定，独立作出是否起诉的决定。
法律背景与建议：
- 在刑事案件中，公安机关和检察院都承担着重要的职责。公安机关负责侦查，收集证据；检察院则负责审查起诉，决定是否将案件提交法院审判。
- 对于当事人而言，如果面临刑事指控，无论公安机关最初是否认为无罪，都应积极配合调查，同时寻求专业律师的帮助，以维护自己的合法权益。
- 律师可以依据法律规定和案件事实，为当事人提供法律咨询、辩护策略制定等服务，帮助当事人更好地应对刑事指控。
可能的法律后果：
- 如果检察院决定起诉，案件将进入法院审判阶段。当事人将面临刑事指控，并可能承担相应的刑事责任。
- 如果检察院决定不起诉，案件将终结，当事人将不会被追究刑事责任。但需要注意的是，不起诉决定并不意味着当事人完全无罪，只是基于现有证据和法律规定，检察院认为不符合起诉条件。
综上所述，刑事案件中公安机关认为无罪，并不意味着检察院一定不会起诉。这取决于案件的具体情况、证据的充分性以及公安机关和检察院对案件性质的认定。如果您面临类似的法律问题，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议和帮助。