针对“员工让公司亏损了钱员工怎么处理”这一问题，以下是一个清晰、详细、有深度的解答：
当员工因工作失误或不当行为导致公司亏损时，处理方式需根据具体情况和法律规定来定。以下是一些可能的处理途径：
依据内部制度要求赔偿：
- 如果员工存在故意或重大过失导致公司损失，公司有权依据内部合法有效的规章制度要求员工赔偿部分损失。
- 赔偿金额的扣除需遵循一定限制，即每月扣除的赔偿金额不得超过员工当月工资的20%。若扣除后工资低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。
协商赔偿并达成协议：
- 公司可以与员工就赔偿事宜进行协商，尝试达成双方都能接受的赔偿协议。
- 协商过程中，应充分考虑员工的经济状况、过失程度以及公司的实际损失等因素。
通过法律途径解决：
- 如果协商不成，公司可以收集员工存在过错及损失数额等相关证据，通过劳动仲裁或诉讼途径来解决争议。
- 在此过程中，公司应确保所提供的证据充分、确凿，以支持其赔偿要求。
追究刑事责任（如适用）：
- 如果员工的行为涉嫌犯罪，如职务侵占等，公司可以向公安机关报案，追究其刑事责任。
- 刑事责任的追究将依据相关法律法规进行，与民事赔偿是两个不同的法律程序。
以案例中的小朱为例，他因工作中的重大过失致使公司亏损几十万元。公司有权依据内部规章制度要求小朱赔偿部分损失，但赔偿金额的扣除需遵循上述限制。如果双方无法就赔偿事宜达成一致，公司可以通过劳动仲裁或诉讼途径来解决争议。同时，如果小朱的行为涉嫌犯罪，公司还可以向公安机关报案追究其刑事责任。
总之，处理员工导致公司亏损的问题时，公司应综合考虑各种因素，遵循法律规定和内部制度，采取合理、合法的处理方式。