当您发现起诉的企业已经注销时，确实会面临一些复杂的法律问题，但请不要担心，我会为您详细解答如何处理这种情况。

首先，要明确的是，企业注销后，其主体资格消灭，通常不能再作为被告被起诉。然而，这并不意味着债务就此免除。如果企业在注销前存在未清算完毕的债务，债权人仍然有权通过法律途径维护自身权益。

针对这种情况，您可以采取以下措施：

1. 收集证据：

   • 收集企业注销的相关材料，如注销登记证明、清算报告（如果有的话）等。
   • 收集能够证明您与企业之间存在债权债务关系的证据，如合同、发票、付款记录等。

2. 确定责任主体：

   • 如果企业未经依法清算即办理注销登记，导致债权人主张权利时公司无法进行清算，您可以主张有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人对公司债务承担清偿责任。
   • 如果在企业注销前，已经成立清算组并公告通知债权人申报债权，但债权人已申报债权却未获清偿，那么您可以根据具体情况看是否能要求清算组成员承担相应责任。

3. 提起诉讼：

   • 在法定期限内，向作出注销决定的登记机关所在地人民法院提起诉讼。
   • 诉讼时，需将确定的债务责任主体列为被告，并提供相关证据和材料。

4. 注意法律规定和诉讼时效：

   • 不同地区在诉讼流程和要求上可能存在差异，因此一定要根据当地实际法律规定和司法实践来操作。
   • 同时，要注意诉讼时效的问题，确保在法定期限内提起诉讼。

5. 寻求专业帮助：

   • 如果您对法律程序不熟悉或存在疑问，建议咨询专业律师以获取更准确的法律建议和帮助。

总之，企业注销并不意味着债务的免除。债权人仍可通过合法途径维护自身权益，但需注意法律规定和诉讼时效等问题。希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。