在车祸中，当双方被认定为承担同等责任时，关于自费药部分的费用承担，确实是一个需要细致考虑的问题。以下是我对此问题的详细解答：
一、总体原则
根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关法律法规，双方都有过错的交通事故，应按照各自过错的比例分担责任。在同等责任下，原则上双方各占50%的责任，因此，医药费（包括自费药部分）的赔偿也应据此进行分担。
二、自费药部分的承担
交强险赔付：
- 首先，双方各自的交强险会在责任限额范围内（一般为医疗费用18000元）对对方的损失进行赔偿。这部分赔偿通常不区分自费药和非自费药，只要是在医疗过程中产生的合理费用，都可以在交强险限额内得到赔付。
超出交强险部分的自费药：
- 对于超出交强险限额的自费药部分，双方应按照同等责任原则进行分担，即各自承担50%。这是因为自费药虽然可能不在保险公司的赔付范围内，但仍然是因车祸而产生的合理医疗费用，应由事故双方根据责任比例共同承担。
商业险的考虑：
- 如果机动车一方投保了商业第三者责任险，并且保险合同中包含了自费药的赔付条款，那么超出交强险限额的自费药部分可能还可以由商业险进行赔付。但具体赔付比例和限额需要依据保险合同来确定。
三、实际操作建议
收集证据：
- 在处理此类问题时，务必收集齐全所有与医疗费用相关的凭证和证明文件，如医药费缴费票据、病历、诊断证明等。这些证据将用于准确计算赔偿金额，并证明自费药的合理性和必要性。
协商解决：
- 在明确责任比例和赔偿金额后，双方可以尝试通过协商来解决赔偿问题。协商过程中，可以就自费药部分的承担比例进行进一步讨论，以达成双方都能接受的解决方案。
法律途径：
- 如果双方无法就赔偿问题达成一致，可以通过法律途径解决争议。例如，向人民法院提起民事诉讼，由法院根据相关法律法规和证据来判定赔偿金额和承担比例。
四、注意事项
- 在处理交通事故赔偿时，应参考最新的法律、行政法规或司法解释，以确保赔偿计算的准确性和合法性。
- 自费药部分的承担可能因地区法律规定和案件情况有所不同，因此在实际操作中需要结合具体情况进行判断。
综上所述，车祸中同等责任下的自费药部分应由双方按照50%的比例共同承担。在处理此类问题时，务必收集齐全相关证据，并尝试通过协商或法律途径来解决赔偿问题。