当被告在收到开庭通知书后死亡，法院的处理方式会根据案件的具体性质（如刑事案件、民事案件或行政案件）以及相关法律规定来综合判断。以下是对这一问题的详细解答：
一、刑事案件
一般原则：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，如果犯罪嫌疑人或被告人在诉讼过程中死亡，法院通常会裁定终止审理，因为不再有追究刑事责任的主体。
- 但如果根据已查明的案件事实和证据材料能确认被告人无罪，法院应判决宣告被告人无罪，以保障其合法权益。
特殊情形：
- 对于某些重大犯罪案件（如贪污贿赂犯罪、恐怖活动犯罪等），若犯罪嫌疑人或被告人死亡且依法应追缴其违法所得及其他涉案财产，人民检察院可向人民法院提出没收违法所得的申请，法院将依法进行审理并作出裁定。
二、民事案件
有遗产和继承人的情况：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，若被告死亡后留有遗产且有继承人继承，原告可将继承人列为被告，要求其在继承遗产范围内承担偿还责任。
- 法院会根据原告的申请变更被告为继承人，并继续审理案件。在审理过程中，法院会审查遗产范围和继承人继承的具体情况，以确定责任范围。
没有遗产或继承人放弃继承的情况：
- 若被告死亡后无遗产或继承人明确表示放弃继承，案件可能因无法实现原告诉讼请求或无责任承担主体而终结。
- 法院会审查具体情况，确保放弃继承的行为合法有效，并据此作出裁定终结诉讼。
三、行政案件
一般情况：
- 在行政诉讼中，若被告（通常是行政机关）在诉讼过程中死亡（这里“死亡”更多指行政机关被撤销或职能转移），法院会根据具体情况决定是否中止诉讼。
- 若被告的权利义务有明确承受主体（如行政机关的职能由其他机关继续行使），法院会通知新的权利义务承受主体参加诉讼并继续审理。
特殊情况：
- 若无明确权利义务承受主体或案件审理需等待其他相关事实查明，法院可能会中止诉讼，待相关情况明确后再恢复审理或作出处理决定。
综上所述，当被告在收到开庭通知书后死亡时，法院的处理方式会综合考虑案件性质、法律规定及具体情况。在处理过程中，法院将严格遵循相关法律法规，确保司法程序的公正性和当事人的合法权益。如果您正面临此类问题，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。