在民间借贷纠纷中，仅凭银行流水起诉被告，而被告抗辩该款项并非借贷时，原告是否会败诉，取决于原告能否提供充分证据证明借贷关系的存在。以下从不同角度进行分析：

1. 银行流水作为证据的效力：

   • 银行流水可以证明双方之间存在资金往来，但仅凭银行流水本身，通常不足以直接证明借贷关系的成立。因为资金往来可能基于多种原因，如赠与、投资、还款等。
   • 因此，银行流水需要与其他证据（如借条、收据、聊天记录、证人证言等）相结合，才能形成完整的证据链，证明借贷关系的存在。

2. 被告抗辩的效力：

   • 被告有权对原告的诉讼请求进行抗辩，包括否认借贷关系的存在。如果被告能够提供合理的抗辩理由和证据，如证明该款项是其他性质的往来，那么原告仅凭银行流水起诉，可能会面临败诉的风险。
   • 法院在审理此类案件时，会综合考虑双方提供的证据和陈述，以及案件的具体情况，来作出判断。

3. 原告的举证责任：

   • 在民间借贷纠纷中，原告作为主张借贷关系成立的一方，需要承担举证责任。即原告需要提供充分的证据来证明借贷关系的存在，包括借款的金额、时间、方式、还款期限等。
   • 如果原告仅凭银行流水起诉，而无法提供其他证据来佐证借贷关系的成立，那么原告可能会因为举证不足而败诉。

4. 法律建议：

   • 对于原告而言，在起诉前应该尽可能收集充分的证据来证明借贷关系的存在。除了银行流水外，还可以尝试获取借条、收据、聊天记录等证据。
   • 如果被告提出抗辩，原告应该积极应对，提供反驳证据和理由，以维护自己的合法权益。
   • 在整个诉讼过程中，原告可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保障。

综上所述，仅凭银行流水起诉被告民间借贷纠纷，而被告抗辩该款项并非借贷时，原告是否会败诉取决于原告能否提供充分证据证明借贷关系的存在。因此，在起诉前应该尽可能收集充分的证据，并在诉讼过程中积极应对被告的抗辩。如有任何法律问题，可以直接向我咨询。