补充协议在一定条件下可以取消原合同中已经生效的条款，但这一取消行为需要满足严格的法律要求和程序。以下是对这一问题的详细分析：
协商一致原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事主体从事民事活动应遵循自愿原则。因此，只要合同双方当事人经过协商一致，并在补充协议中明确表示取消原合同的某些条款，该约定即为有效。这是补充协议能够取消原合同条款的基本前提。
补充协议的合法性与有效性：
- 补充协议必须合法有效，才能对原合同条款产生取消或变更的效力。这要求补充协议的内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。同时，补充协议的形式也应符合法律规定，如采用书面形式等。
明确表达取消意愿：
- 补充协议中必须明确表达取消原合同条款的意愿。这种意愿应当是清晰、无歧义的，以便在发生争议时能够作为判断依据。
无效或可撤销的情形：
- 如果补充协议存在无效或可撤销的情形，如缺乏民事行为能力、意思表示不真实、内容违法违规等，则该补充协议不能取消原合同条款。在这种情况下，原合同条款继续有效。
具体分析：
有效取消的情形：当补充协议满足上述条件时，它可以有效地取消原合同中已经生效的条款。例如，双方在原合同中约定了某种服务或产品的价格，但后来由于市场变化等原因，双方协商一致并通过补充协议取消了原价格条款，重新约定了新的价格。
无效或不可取消的情形：如果补充协议存在无效或可撤销的情形，如一方在签订补充协议时受到欺诈或胁迫，或者补充协议的内容违反了法律、行政法规的强制性规定等，则该补充协议不能取消原合同条款。在这种情况下，受损害方有权请求人民法院或仲裁机构变更或撤销该补充协议，原合同条款继续有效。
法律建议：
- 在签订补充协议前，双方应仔细审查原合同条款和补充协议内容，确保补充协议的合法性和有效性。
- 如有必要，可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。
- 在补充协议中明确表达取消原合同条款的意愿，并确保该意愿符合法律规定和双方的真实意思表示。
总之，补充协议在一定条件下可以取消原合同中已经生效的条款，但这一取消行为需要满足严格的法律要求和程序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。