在保单注明保险人是营业部但盖章是分公司的情况下，原告可以选择起诉营业部或分公司，或者将两者共同作为被告提起诉讼。以下是对此问题的详细分析：

一. 诉讼主体的确定

1. 营业部与分公司的诉讼主体资格：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》第四十八条，公民、法人和其他组织可以作为民事诉讼的当事人。
   • 《最高人民法院关于适用<中华人民共和国民事诉讼法>的解释》第五十二条进一步明确了“其他组织”的范围，包括依法设立并领取营业执照的商业银行、政策性银行和非银行金融机构的分支机构。因此，无论是营业部还是分公司，只要其依法设立并领取了营业执照，就具有诉讼主体资格。

2. 营业部与分公司的关系：

   • 通常情况下，营业部是分公司下属的一个具体业务单位，两者之间存在管理与被管理的关系。
   • 在保险合同中，如果保单上注明的是营业部，但实际盖章的是分公司，这通常意味着分公司对营业部的业务行为承担了相应的责任。

二. 原告的选择权

• 鉴于营业部与分公司均具备诉讼主体资格，并且两者之间存在管理与被管理的关系，原告在提起诉讼时，可以根据方便诉讼的原则，选择起诉营业部、分公司，或者将两者共同作为被告。

三. 法律依据

• 《中华人民共和国民事诉讼法》第四十八条：公民、法人和其他组织可以作为民事诉讼的当事人。
• 《最高人民法院关于适用<中华人民共和国民事诉讼法>的解释》第五十二条：民事诉讼法第四十八条规定的其他组织是指合法成立、有一定的组织机构和财产，但又不具备法人资格的组织，包括依法设立并领取营业执照的商业银行、政策性银行和非银行金融机构的分支机构。

综上所述，在保单注明保险人是营业部但盖章是分公司的情况下，原告具有选择权，可以根据实际情况选择起诉营业部、分公司，或者将两者共同作为被告提起诉讼。如有进一步需要，您可以继续咨询我。