打着疫情的名义拆除顶楼菜地是否违法，需要分情况讨论：
若拆除行为有合法依据且程序正当：
- 在疫情防控等特殊时期，政府或相关部门可能会根据法律法规或政策要求，对某些可能影响公共卫生、安全或防疫工作的行为进行限制或管理。如果拆除顶楼菜地的行为是基于这样的合法依据，并且经过了正当的程序（如提前通知、说明理由、给予申诉机会等），那么这种拆除行为可能并不违法。
- 然而，即便有合法依据，拆除行为也必须遵循比例原则，即拆除行为与所追求的公共利益之间应当保持适当的比例，不能过度侵犯个人的合法权益。
若拆除行为无合法依据或程序不当：
- 如果拆除顶楼菜地的行为没有明确的法律依据，或者虽然有法律依据但程序不当（如未提前通知、未说明理由、未给予申诉机会等），那么这种拆除行为就可能构成违法。
- 在这种情况下，被拆除者有权要求相关部门说明拆除的理由和依据，并可以依法寻求救济，如提起行政复议或行政诉讼等。
从法律角度来看：
- 顶楼菜地作为个人的财产或使用权范围，其拆除必须遵循法律法规的规定。任何未经法定程序或无合法依据的拆除行为，都可能构成对个人财产权的侵犯。
- 同时，疫情防控等特殊时期虽然赋予了政府或相关部门一定的特殊权力，但这些权力的行使也必须受到法律的约束和监督，不能随意侵犯个人的合法权益。
给你的建议：
- 如果你认为拆除顶楼菜地的行为违法，可以首先收集相关证据，如拆除前后的照片、视频、通知等。
- 然后，你可以向相关部门提出申诉或投诉，要求其说明拆除的理由和依据，并可以依法寻求救济。
- 如果你对法律程序不熟悉或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。
总之，打着疫情的名义拆除顶楼菜地是否违法，需要具体分析拆除行为的合法性和程序正当性。如果你对此有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。