房屋征收协议起诉期限为20年，在特定情况下是合法的。以下是对这一问题的详细分析：

1. 行政诉讼视角下的起诉期限：

   • 根据《行政诉讼法》的相关规定，公民、法人或其他组织直接向法院提起诉讼的，应自知道或应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。但法律另有规定的除外。
   • 若因不动产提起诉讼，自行政行为作出之日起超过二十年，法院将不予受理。这意味着，在涉及不动产（如房屋征收）的行政诉讼中，最长起诉期限为二十年。

2. 民事诉讼视角下的起诉期限：

   • 根据《民法典》的规定，向法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。诉讼时效期间自权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
   • 然而，自权利受到损害之日起超过二十年的，法院将不予保护。有特殊情况的，法院可根据权利人的申请决定延长。在房屋征收协议纠纷中，若通过民事诉讼解决，且涉及不动产，则最长诉讼时效同样为二十年（但需注意，民事诉讼中的“二十年”为最长权利保护期间，与行政诉讼中的“二十年”起诉期限在性质上有所不同，前者为权利保护的最长期限，后者为起诉的最长期限）。

3. 综合分析：

   • 在房屋征收协议纠纷中，起诉期限的长短取决于诉讼类型（行政诉讼或民事诉讼）以及具体案情。
   • 若通过行政诉讼解决，且涉及不动产，则起诉期限最长为二十年（自行政行为作出之日起计算）。
   • 若通过民事诉讼解决，且涉及不动产，则权利保护的最长期限为二十年（自权利受到损害之日起计算），但起诉期限可能因具体情况而有所不同，通常为三年（自权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算）。

4. 法律建议：

   • 在处理房屋征收协议纠纷时，应准确判断诉讼类型，并了解相应的起诉期限或权利保护期限。
   • 及时主张权利，避免因超过时效而丧失胜诉权。
   • 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。

综上所述，房屋征收协议起诉期限为20年，在特定情况下（如涉及不动产的行政诉讼或民事诉讼中的最长权利保护期间）是合法的。但具体起诉期限或权利保护期限的长短还需根据诉讼类型和具体案情来判断。