协议20年后起诉是否有效，这主要取决于协议的性质、内容以及是否超过了法律规定的诉讼时效。以下从不同角度为你详细分析：
一、协议性质与内容的影响
民事协议的一般规定：
- 对于一般的民事协议，如买卖合同、租赁合同等，只要协议内容合法、双方意思表示真实，且未违反法律、行政法规的强制性规定，该协议就是有效的。
- 协议的有效期通常由双方自行约定，如果没有约定，则可能根据协议的性质和交易习惯来确定。但无论协议的有效期多长，只要协议内容合法，且未被撤销或解除，协议本身在法律上就是持续有效的。
特殊协议的特殊规定：
- 对于某些特殊类型的协议，如婚姻协议、收养协议等，法律可能有特别的规定。例如，婚姻协议中的某些条款可能因违反公序良俗或法律强制性规定而无效。
- 如果协议涉及不动产、知识产权等特殊财产，还可能受到相关专门法律的调整。
二、诉讼时效的考虑
一般诉讼时效：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这意味着，如果一方在协议履行过程中受到损害，通常需要在三年内提起诉讼，否则可能丧失胜诉权。
- 但需要注意的是，诉讼时效的起算点通常是从权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。因此，如果协议履行过程中出现问题，但权利人当时并未察觉，诉讼时效可能并不会立即开始计算。
最长诉讼时效：
- 除了三年的一般诉讼时效外，法律还规定了最长诉讼时效，即自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护。这意味着，即使权利人不知道或不应知道权利受到损害，如果超过了二十年，也可能无法再通过诉讼来维护自己的权益。
- 但这一规定并非绝对。在某些特殊情况下，如权利人因不可抗力或其他障碍不能行使请求权的，诉讼时效可能中止或中断。此外，如果法律另有规定或当事人另有约定，也可能影响诉讼时效的计算。
三、具体案例分析
- 假设案例一：如果是一份普通的买卖合同，双方约定了交货时间和付款方式，但20年后卖方才起诉买方未付款。此时，如果买方能证明卖方在起诉前已经知道或应当知道买方未付款，且超过了三年的诉讼时效，那么卖方可能因超过诉讼时效而丧失胜诉权。但如果买方无法证明这一点，或者存在诉讼时效中止、中断的情形，卖方仍有可能胜诉。
- 假设案例二：如果是一份涉及不动产的协议，如房屋买卖合同，且双方约定了20年后办理过户手续。如果20年后一方起诉要求履行协议，此时诉讼时效的计算可能更为复杂。因为不动产的交付和过户可能涉及多个法律环节和多个权利主体，需要具体分析每个环节的诉讼时效问题。
四、法律建议
- 及时行使权利：如果你认为自己的权益受到了侵害，应及时向对方主张权利，并考虑通过法律途径来维护自己的权益。不要拖延时间，以免超过诉讼时效。
- 保留证据：在协议履行过程中，应妥善保留相关证据，如协议文本、付款凭证、交货凭证等。这些证据在后续可能发生的纠纷中将起到至关重要的作用。
- 咨询专业律师：如果你对协议的有效性或诉讼时效问题存在疑问，建议咨询专业律师。律师可以根据你的具体情况和法律规定，为你提供专业的法律意见和帮助。
综上所述，协议20年后起诉是否有效并没有一个简单的答案。它取决于协议的性质、内容以及是否超过了法律规定的诉讼时效。如果你面临类似的问题，建议直接向我咨询，以便我能根据你的具体情况为你提供更准确的法律意见。