九十年代公安机关办理劳动教养案件程序的主要法律依据为当时有效的《国务院关于劳动教养问题的决定》及相关配套规定。以下是对该法律依据及办理程序的详细分析：

1. 法律依据：

   • 在九十年代，公安机关办理劳动教养案件的主要法律依据是1957年8月1日公布的《国务院关于劳动教养问题的决定》，以及随后由公安部等部门发布的配套规定和实施细则。这些法规和规定为公安机关办理劳动教养案件提供了明确的法律框架和程序要求。

2. 办理程序：

   • 立案与审查：公安机关在发现需要劳动教养的人员后，会进行立案审查，确定是否符合劳动教养的条件。
   • 调查取证：公安机关会进行调查取证工作，收集相关证据，以证明被劳动教养人员的行为符合劳动教养的条件。
   • 决定与审批：在调查取证结束后，公安机关会提出劳动教养的意见，并报请上级公安机关或劳动教养管理委员会审批。审批通过后，会作出劳动教养的决定。
   • 通知与执行：公安机关会向被劳动教养人员及其家属发出劳动教养通知书，并按照规定将其送往劳动教养场所执行。

3. 注意事项：

   • 需要注意的是，随着时代的发展和法律体系的完善，劳动教养制度已经发生了重大变化。目前，劳动教养制度已经被废止，取而代之的是更为完善和科学的社区矫正、强制隔离戒毒等制度。
   • 对于九十年代公安机关办理劳动教养案件的具体程序和细节，由于历史久远且相关法规已经废止，可能难以获取完整的原始资料。但根据当时的法律法规和办理程序，可以推断出大致的流程和要求。

4. 法律建议：

   • 如果您对九十年代公安机关办理劳动教养案件的具体程序或法律依据有进一步的疑问或需要更详细的法律解释，建议直接向我咨询。作为擅长劳动工伤（劳动仲裁）领域的律师，我可以为您提供专业的法律咨询和解答。

综上所述，九十年代公安机关办理劳动教养案件程序的主要法律依据为当时有效的《国务院关于劳动教养问题的决定》及相关配套规定。虽然目前劳动教养制度已经废止，但了解其历史背景和法律依据对于理解我国法律体系的发展和完善具有重要意义。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。