公司开除员工后双方达成的赔偿协议通常是有效的，但具体效力还需根据协议的具体内容和签订过程来判断。以下是对这一问题的详细分析：

1. 协议有效的条件：

   • 双方自愿：协议必须是公司与员工在平等、自愿的基础上达成的，没有任何一方受到欺诈、胁迫或乘人之危等情形。
   • 内容合法：协议的内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。
   • 明确无歧义：协议条款应清晰明确，无歧义，双方对协议内容有充分的理解和认知。

2. 协议可能无效或可撤销的情形：

   • 存在欺诈、胁迫：如果公司在签订协议时存在欺诈、胁迫等不正当手段，导致员工在违背真实意愿的情况下签订了协议，那么员工有权请求法院或仲裁机构撤销该协议。
   • 显失公平：如果协议内容显失公平，例如赔偿金额远低于法定标准或员工应得的权益，员工也可以主张变更或撤销协议。

3. 法律后果：

   • 如果协议被认定为有效，双方应严格按照协议约定履行各自的义务。公司应按时支付赔偿金额，员工则不得再就劳动关系或任何理由向公司主张权利或增加补偿。
   • 如果协议被撤销或变更，双方应根据法院或仲裁机构的裁决来重新确定各自的权利和义务。

综上所述，公司开除员工后双方达成的赔偿协议在符合一定条件下是有效的。但为了确保协议的合法性和有效性，建议双方在签订前充分协商、明确条款内容，并必要时可寻求专业律师的帮助进行审查和指导。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。